结论是：知道老公有小三两年之后再起诉是否有效，这取决于您想要起诉的具体事项以及是否满足相应的法律条件，尤其是诉讼时效的问题。 下面我从几个可能的角度来详细分析：
如果是起诉离婚并主张损害赔偿：
- 根据《民法典》的相关规定，夫妻一方有重婚、与他人同居等重大过错导致离婚的，无过错方有权请求损害赔偿。这里的关键是，您需要证明老公与小三存在重婚或同居的行为，而不仅仅是知道有小三的存在。
- 关于诉讼时效，一般来说，请求损害赔偿的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。因此，如果您在知道老公有小三后的两年内提起离婚诉讼并主张损害赔偿，且能证明相关过错行为，那么通常是有效的。但如果您拖延过久，可能会面临诉讼时效过期的问题，不过具体还需看您何时“知道或应当知道”权利受损，以及是否有诉讼时效中断、中止等情形。
如果是起诉要求确认老公与小三的赠与行为无效并返还财产：
- 如果老公在婚姻关系存续期间，未经您同意，将夫妻共同财产赠与给小三，您有权起诉要求确认该赠与行为无效，并要求小三返还财产。
- 在这种情况下，诉讼时效同样是一个需要考虑的因素。但一般来说，只要您能证明赠与行为的存在以及该行为侵犯了您的财产权益，且未超过诉讼时效期间（通常为三年），您的起诉就是有效的。不过，如果赠与行为发生在很久之前，且您一直不知情，那么诉讼时效可能会从您知道或应当知道之日起计算。
关于诉讼时效的特别提醒：
- 诉讼时效的计算可能因具体情况而有所不同，比如是否存在诉讼时效中断、中止的情形。例如，如果您在知道老公有小三后，曾与老公进行协商或寻求其他途径解决，这可能会构成诉讼时效的中断。
- 另外，即使超过了诉讼时效期间，您仍然可以起诉，但对方可能会提出诉讼时效抗辩，导致您的诉求得不到法院的支持。因此，及时行使权利是非常重要的。
建议：
- 如果您打算起诉，建议尽快收集相关证据，如老公与小三的聊天记录、照片、视频等，以证明他们的过错行为或赠与行为。
- 同时，咨询专业律师（比如我，张翠云律师，专注于婚姻家庭领域），了解具体的法律程序和诉讼策略，以确保您的权益得到最大程度的保护。
- 记住，法律不保护躺在权利上睡觉的人，及时行使权利是维护自身权益的关键。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您有任何其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。