结论上讲，高层次人才引进服务期内完不成两项国家级基金是否会被辞退，不能一概而论，这主要取决于引进协议中的具体约定以及相关法律法规的规定。以下从几个方面进行详细分析：
一、引进协议的具体约定
协议内容：高层次人才引进时，通常会签订一份引进协议，其中会明确双方的权利和义务，包括服务期限、工作任务、考核标准以及违约责任等。如果协议中明确规定了完不成两项国家级基金作为辞退的条件，那么一旦未达成，用人单位可能有权依据协议进行辞退。
协议解释：然而，即使协议中有相关约定，也需要对协议条款进行合理解释。如果条款表述模糊或存在多种解释，应当倾向于保护劳动者的权益，避免用人单位滥用辞退权。
二、相关法律法规的规定
劳动合同法：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位辞退劳动者应当符合法定条件，如劳动者严重违反用人单位的规章制度、严重失职或营私舞弊给用人单位造成重大损害等。如果完不成两项国家级基金并不构成上述法定辞退条件，用人单位则不能随意辞退。
地方性法规：此外，一些地方可能针对高层次人才引进制定了专门的地方性法规或政策，其中可能包含对辞退条件的特殊规定。因此，在具体案件中，还需要考虑地方性法规的适用。
三、实际操作的考量
协商与沟通：在实际操作中，如果高层次人才未能完成引进协议中的任务，用人单位通常会先与劳动者进行协商，寻求解决方案，如延长服务期限、调整工作任务等，而不是直接辞退。
证据收集与举证：如果用人单位决定辞退劳动者，需要收集充分的证据证明劳动者未履行协议义务，且该未履行行为构成了辞退的合法理由。否则，用人单位可能面临违法辞退的法律风险。
四、建议与措施
审查协议：对于高层次人才而言，在签订引进协议时，应仔细审查协议条款，特别是关于工作任务、考核标准以及违约责任等方面的约定，确保自己的权益得到充分保障。
积极沟通：如果在实际工作中遇到困难或挑战，导致无法按时完成协议任务，应及时与用人单位进行沟通，寻求支持和帮助，共同寻找解决方案。
法律维权：如果用人单位违反协议约定或相关法律法规进行辞退，劳动者可以通过法律途径维护自己的合法权益，如申请劳动仲裁或提起诉讼等。
综上所述，高层次人才引进服务期内完不成两项国家级基金是否会被辞退，取决于多种因素的综合考量。如果你或你身边的人遇到类似情况，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更详细的法律建议。