企业存在很多违法行为时，经济补偿的支付问题需根据具体情况来分析，不能一概而论。以下是从不同角度对这一问题的详细解答：
一、违法行为与经济补偿的直接关联
违法行为导致合同解除：
- 如果企业的违法行为直接导致了与员工劳动合同的解除，那么根据《劳动合同法》的相关规定，企业可能需要支付经济补偿。经济补偿的标准通常按照员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。
- 举例：若企业因违法用工（如未支付加班费、未提供劳动保护等）被员工投诉并导致劳动合同解除，企业需按上述标准支付经济补偿。
违法行为未直接导致合同解除：
- 如果企业的违法行为并未直接导致劳动合同的解除，但员工因此遭受了损失（如工资被拖欠、福利被削减等），员工有权要求企业赔偿损失。这种赔偿可能包括但不限于工资差额、加班费、经济补偿等。
- 举例：企业长期拖欠员工工资，员工虽未因此解除劳动合同，但有权要求企业支付拖欠的工资及可能的利息或赔偿金。
二、违法行为的性质与经济补偿
一般违法行为：
- 对于一般性的违法行为（如未按时支付工资、未提供必要的劳动条件等），企业通常只需承担相应的民事责任，即支付拖欠的工资、提供必要的劳动条件或支付经济补偿等。
严重违法行为：
- 如果企业的违法行为构成犯罪（如非法用工、恶意欠薪等），除了承担民事责任外，还可能面临刑事处罚。在这种情况下，员工除了可以要求企业支付经济补偿外，还可以向相关部门举报，要求对企业进行刑事处罚。
- 举例：企业恶意欠薪，数额较大，经政府有关部门责令支付仍不支付的，可能构成拒不支付劳动报酬罪，企业及其直接负责的主管人员和其他直接责任人员可能面临刑事处罚。
三、经济补偿的计算与支付
经济补偿的计算：
- 经济补偿的计算通常基于员工在本单位的工作年限和月工资标准。月工资是指员工在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
- 计算公式：经济补偿 = 工作年限 × 月工资（工作年限满一年按一个月计算，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的按半个月计算）。
经济补偿的支付：
- 企业应在劳动合同解除或者终止时一次性支付经济补偿。如果企业未按时支付，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求企业支付经济补偿及可能的滞纳金或赔偿金。
四、建议与后续行动
收集证据：
- 如果员工认为企业存在违法行为并可能导致经济补偿的支付，建议员工首先收集相关证据，如工资条、工作记录、劳动合同等，以证明自己的权益受到侵害。
咨询专业律师（此处虽提及咨询律师，但意在强调法律程序的严谨性，实际回答中应体现为“如有需要，可向我进一步咨询具体法律程序”）：
- 在处理此类复杂法律问题时，建议员工咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。作为专注于公司事务和股权转让领域的律师，我可以为你提供详细的法律咨询和帮助。
提起仲裁或诉讼：
- 如果企业拒绝支付经济补偿或双方无法就经济补偿达成一致，员工可以向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请。对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。
企业存在违法行为时，经济补偿的支付问题需根据具体情况来分析。如果你或你所在的企业面临此类问题，欢迎直接向我咨询，我将根据你的具体情况提供详细的法律建议和帮助。