公司规定年休假不休过期作废的做法是不合法的，这一规定违反了《职工带薪年休假条例》及《企业职工带薪年休假实施办法》的相关规定，具体分析如下：

1. 年休假安排原则与灵活性：

   • 根据《职工带薪年休假条例》第五条，单位应根据生产、工作的具体情况，并考虑职工本人意愿，统筹安排职工年休假。年休假在1个年度内可以集中安排，也可以分段安排，一般不跨年度安排。但在特殊情况下，如单位因生产、工作特点确有必要跨年度安排职工年休假的，可以跨1个年度安排。这表明，年休假并非绝对在年末过期，而是具有一定的灵活性。

2. 应休未休年休假的补偿机制：

   • 若单位确因工作需要不能安排职工休年休假的，经职工本人同意，可以不安排职工休年休假。但对于职工应休未休的年休假天数，单位应当按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬。这意味着，即使职工未休年休假，单位也有义务进行补偿，而非简单地规定“过期作废”。

3. 员工放弃年休假的合法性：

   • 员工有权选择是否休年休假。只有在员工因个人原因书面提出不休年休假，并且公司已按照正常出勤支付了工资报酬的情况下，公司规定未休年假到期作废才可能被视为合法。但这种情况需要员工明确、积极地表示放弃年休假，而非公司单方面规定。

4. 公司规定的合法性审查：

   • 公司制定的规章制度必须符合法律法规的规定，且需经过民主程序制定并向员工公示或告知。如果公司未经员工同意擅自将未休完的年假清零，且不支付相应的未休年休假工资报酬，则违反了法律法规，员工有权通过合法途径维护自己的合法权益。

建议与总结：

• 对于公司：应严格遵守国家法律法规，合理安排职工的年休假，确保劳动者的合法权益不受侵害。在制定规章制度时，应确保规章制度的合法性，并经过民主程序制定并向员工公示或告知。
• 对于员工：应了解自己的年休假权利，并在必要时采取法律手段维护自己的合法利益。如果发现公司存在违法规定或侵害自己年休假权利的行为，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

总之，公司规定年休假不休过期作废的做法是不合法的，员工应了解自己的权益，并在必要时寻求法律帮助以维护自身利益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。