结论前置：签一年合同实习期（实际应为试用期）三个月是不合理的，且违反了《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定。对于一年期限的劳动合同，试用期不得超过二个月。
法律背景与依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》第十九条的规定：
- 劳动合同期限三个月以上不满一年的，试用期不得超过一个月；
- 劳动合同期限一年以上不满三年的，试用期不得超过二个月；
- 三年以上固定期限和无固定期限的劳动合同，试用期不得超过六个月。
此外，同一用人单位与同一劳动者只能约定一次试用期，且以完成一定工作任务为期限的劳动合同或劳动合同期限不满三个月的，不得约定试用期。
具体分析
试用期期限的合法性：
- 在您提到的案例中，劳动合同期限为一年，根据法律规定，试用期最长不得超过二个月。因此，约定三个月的试用期显然超出了法定的最长期限，是不合法的。
超出部分的法律后果：
- 如果用人单位约定的试用期超过了法律规定的上限，那么超出的部分将被视为无效，按正式合同期限处理。这意味着，在本案例中，第三个月的试用期将被视为正式合同期，劳动者应享受正式员工的待遇和权益。
劳动者的权益保护：
- 面对不合理的试用期约定，劳动者可以通过多种途径来维护自己的合法权益：
- 与用人单位协商调整试用期的长度；
- 向劳动行政部门投诉，请求其介入调查并纠正违法行为；
- 申请劳动仲裁，通过法律程序来解决争议，并要求用人单位支付超出法定试用期期间的工资差额等。
实际建议
与用人单位沟通：
- 首先，您可以尝试与用人单位沟通，明确指出试用期约定违反了法律规定，并要求用人单位按照法律规定调整试用期的长度。
保留证据：
- 在沟通过程中，务必保留好相关证据，如劳动合同、沟通记录等，以备后续维权之需。
寻求法律帮助：
- 如果用人单位拒绝调整试用期长度或拒绝支付超出法定试用期期间的工资差额等，您可以向我咨询，我将根据您的具体情况提供进一步的法律建议和帮助。
总之，签一年合同实习期（试用期）三个月是不合理的，且违反了法律规定。劳动者应了解自己的合法权益，并在必要时采取相应措施维护自身权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。