结论：药品配送合同签五年后，如果发现不利于单位工作，是可以签补充协议的，但需满足一定条件并遵循相关法律规定。

分析如下：

1. 补充协议的法律基础：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方当事人在不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗的前提下，可以协商一致对原合同进行变更或补充。这意味着，如果药品配送合同已经签订了五年，但单位发现该合同在某些方面不利于工作开展，双方完全可以通过协商签订补充协议来调整合同内容。

2. 签订补充协议的条件：

   • 双方协商一致：补充协议的签订必须基于双方当事人的自愿和协商一致。任何一方不得强迫对方接受不利的条款。
   • 内容合法合规：补充协议的内容必须符合法律、行政法规的规定，不得违反公序良俗。例如，不能通过补充协议来规避税收、逃避法律责任等。
   • 不损害第三方利益：补充协议的签订不得损害国家、集体或第三人的利益。如果补充协议的内容涉及到第三方权益，必须得到第三方的同意或认可。

3. 补充协议的具体内容：

   • 补充协议可以针对原合同中的任何条款进行变更或补充，包括但不限于配送时间、配送方式、配送费用、违约责任等。单位可以根据实际需要，与配送方协商确定具体的补充内容。

4. 签订补充协议的程序：

   • 起草补充协议：双方应指定代表或委托律师起草补充协议，明确变更或补充的内容、生效条件、履行期限等。
   • 审核与修改：起草完成后，双方应认真审核补充协议的内容，确保无误后进行修改和完善。
   • 签署与盖章：双方代表在补充协议上签字并加盖公章或合同专用章，以表示对补充协议的认可和接受。
   • 备案与存档：签署完成后，双方应将补充协议进行备案和存档，以备后续查阅和履行。

5. 可能遇到的法律风险及防范：

   • 合同无效风险：如果补充协议的内容违反法律、行政法规的强制性规定或公序良俗，可能导致合同无效。因此，在签订补充协议前，双方应仔细审查合同内容，确保合法合规。
   • 履行不能风险：如果补充协议中的条款过于苛刻或难以实现，可能导致一方或双方无法履行合同义务。因此，在签订补充协议时，双方应充分考虑实际情况和可行性，确保合同能够顺利履行。
   • 纠纷解决机制：为避免未来可能出现的纠纷，双方可以在补充协议中明确纠纷解决机制，如协商、调解、仲裁或诉讼等。这样可以在纠纷发生时迅速找到解决方案，减少损失和影响。

建议：

• 在签订补充协议前，单位应充分评估原合同的执行情况和存在的问题，明确需要变更或补充的内容。
• 单位应与配送方进行充分沟通和协商，确保双方对补充协议的内容达成一致意见。
• 在签订补充协议时，单位可以委托专业律师进行法律审查和指导，以确保补充协议的合法性和有效性。

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