1. 结论概述：自然资源的所有权和使用权是否依登记生效，需根据具体情况判断。依法属于国家所有的自然资源所有权可以不登记，但在设立用益物权、担保物权以及进行自然资源统一确权登记时，仍需依法进行登记。

2. 所有权登记情况：

   • 国家所有自然资源：根据《中华人民共和国民法典》第二百零九条第二款，依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。这是因为国家所有自然资源的所有权已通过法律明确规定，具有更强的公示力，无需通过登记来生效。
   • 登记的例外情况：尽管国家所有自然资源的所有权可以不登记，但在实际利用中，如设立用益物权（如土地承包经营权、林地使用权等）或担保物权（如抵押权）时，登记成为必要步骤。这是为了明确权利归属，避免纠纷，并加强资源的管理和保护。

3. 使用权登记情况：

   • 用益物权设立：当自然资源的使用权以用益物权的形式设立时，如土地承包经营权、建设用地使用权等，必须依法进行登记。登记是设立用益物权的重要法律程序，未经登记，不发生物权效力。
   • 自然资源统一确权登记：根据自然资源统一确权登记制度，对水流、森林、山岭、草原、荒地、滩涂、海域、无居民海岛及探明储量的矿产资源等自然资源进行统一确权登记。这一制度旨在清晰界定国土空间内各类自然资源资产的所有权主体，划清全民所有与集体所有的边界，以及不同类型自然资源之间的边界。因此，在使用自然资源时，如果涉及这些资源的统一确权登记，也需要依法进行登记。

4. 登记的法律意义：

   • 明确产权归属：登记是明确自然资源所有权和使用权归属的重要手段。通过登记，可以清晰地界定资源的权利主体，避免产权纠纷。
   • 保障交易安全：在自然资源流转、抵押等交易活动中，登记确保了交易的合法性和安全性。潜在交易方可以通过查询登记信息了解资源状况，降低交易风险。
   • 加强管理和保护：登记过程中记录的自然资源类型、范围、数量、质量等信息，为管理部门提供了全面的数据支持。这有助于管理部门制定科学合理的管理和保护规划，实现资源的可持续利用。

5. 实际应用指导：

   • 在处理自然资源所有权和使用权问题时，应首先判断资源的性质（是否属于国家所有）以及权利的类型（所有权还是使用权）。
   • 如果涉及国家所有自然资源的所有权，且未设立用益物权或担保物权，则可以不进行登记。
   • 如果涉及自然资源的使用权设立或流转，特别是用益物权的设立和自然资源统一确权登记，则必须依法进行登记。

在实际操作中，如果遇到关于自然资源所有权和使用权登记的具体问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。