核心结论：若公司受伤出院后医生开具的证明建议在家休养，这通常不影响你后续主张工伤权益，但需注意及时进行工伤认定、保存好相关证据，并根据休养情况与单位沟通工资待遇等事宜。以下是详细说明：
关于工伤认定
- 医生开具的在家休养证明是重要的病情证据，但它本身不是工伤认定的直接依据。根据《工伤保险条例》规定，职工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的，应当认定为工伤。你受伤出院后，应尽快让单位在事故发生之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。如果单位未按规定申请，你自己或你的近亲属、工会组织可以在事故伤害发生之日起1年内，直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
- 在申请工伤认定时，除了医生开具的在家休养证明外，还需要提供其他相关证据，如劳动合同、工作证、考勤记录、事故现场照片、证人证言等，以证明你是在工作时间和工作场所内因工作原因受伤。
关于停工留薪期
- 医生建议在家休养的期间，一般属于停工留薪期。停工留薪期是指职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的期间。在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
- 停工留薪期一般不超过12个月。伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。你可以根据医生的建议和自身的伤情情况，与单位协商确定停工留薪期的具体期限。如果单位对停工留薪期有异议，可以申请劳动能力鉴定委员会进行确认。
关于后续治疗和劳动能力鉴定
- 在家休养期间，如果伤情出现变化或者需要进一步治疗，应及时就医，并保存好相关的医疗费用票据、诊断证明等证据。
- 待伤情相对稳定后，存在残疾、影响劳动能力的，应当进行劳动能力鉴定。劳动能力鉴定是指劳动功能障碍程度和生活自理障碍程度的等级鉴定。劳动功能障碍分为十个伤残等级，最重的为一级，最轻的为十级。生活自理障碍分为三个等级：生活完全不能自理、生活大部分不能自理和生活部分不能自理。根据劳动能力鉴定结果，你可以享受相应的工伤保险待遇，如一次性伤残补助金、伤残津贴等。
关于与单位的沟通协商
- 在家休养期间，要与单位保持密切沟通，及时告知单位自己的伤情恢复情况和治疗进展。同时，了解单位对于工伤处理的政策和流程，协商确定停工留薪期工资的支付方式、时间等事宜。
- 如果与单位在工伤认定、停工留薪期、工伤保险待遇等方面发生争议，可以通过协商、调解、仲裁等途径解决。你可以先与单位进行协商，如果协商不成，可以向企业劳动争议调解委员会、基层人民调解组织或者在乡镇、街道设立的具有劳动争议调解职能的组织申请调解。调解不成或者不愿调解的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。