工伤休假期间，全勤奖一般不应被扣除，但具体还需根据劳动合同、集体合同或企业规章制度的合法约定来判断。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《工伤保险条例》第三十三条的明确规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”通常包括员工受伤前正常出勤时的所有待遇，全勤奖作为与出勤挂钩的一种奖励，理应被视为原工资福利待遇的一部分。工伤是由于工作原因导致的，职工在此期间的缺勤并非出于个人过错或故意，因此单位不应以此为由扣除全勤奖。

二、特殊情况考虑

1. 企业规章制度、劳动合同或集体合同的特别约定：

   • 若企业的规章制度、劳动合同或集体合同中对于全勤奖的发放有特别约定，并且这些约定是合法、合理且不违反法律法规强制性规定的，那么可能需要根据这些约定来处理。
   • 例如，如果规章制度明确规定了全勤奖的发放条件是职工一个月内无任何缺勤记录，且该制度已经过民主程序制定并向职工公示，那么在工伤休息期间，按照该规定可能不发放全勤奖。但即便如此，单位仍需确保工伤职工在停工留薪期内的整体工资福利待遇不降低，可能需要通过其他方式（如调整工资结构、提供补偿等）来保障职工的权益。

2. 停工留薪期的确定：

   • 停工留薪期一般不超过12个月，特殊情况下可适当延长，但延长不得超过12个月。在此期限内，员工的考勤应被视为正常出勤，因此全勤奖一般不应被扣除。

三、实际操作建议

1. 查看合同约定：

   • 在处理工伤休息期间全勤奖的问题时，首先应查阅劳动合同、集体合同或企业规章制度中是否有关于全勤奖的具体约定。

2. 评估合法性：

   • 对于存在的约定，需评估其是否合法、合理且符合法律法规的规定。若存在违法或不合理之处，应依法进行调整或纠正。

3. 沟通协商：

   • 在出现争议时，建议单位与工伤职工进行积极沟通协商，寻求双方都能接受的解决方案。这有助于维护良好的劳动关系，避免不必要的法律纠纷。

4. 依法处理：

   • 若无法达成一致意见，应依法向相关部门申请调解、仲裁或提起诉讼，以维护双方的合法权益。

四、总结与提醒

工伤休假期间全勤奖的发放问题，既涉及法律法规的规定，也涉及企业规章制度和劳动合同的约定。在大多数情况下，工伤休假期间全勤奖不应被扣除，但具体还需根据实际情况和合同约定来判断。作为工伤职工，应了解自己的合法权益，并在必要时寻求法律帮助。作为企业，应严格遵守法律法规的规定，确保工伤职工的合法权益得到充分保障。

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