工伤请假期间，全勤奖一般不应被扣除，但具体还需根据劳动合同、集体合同或企业规章制度的合法约定来判断。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据与原则

根据《工伤保险条例》第三十三条的规定，职工因工作遭受事故伤害或患职业病需要暂停工作接受医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”应理解为职工在正常出勤情况下所享有的全部薪资和福利待遇，全勤奖作为与出勤挂钩的一种奖励，理应被视为原工资福利待遇的一部分。因此，从法律精神出发，工伤期间职工因非主观原因缺勤，其全勤奖原则上不应被扣除。

二、公司规章制度的考量

尽管法律规定了工伤期间的待遇原则，但实际操作中还需考虑公司的具体规章制度。若公司规章制度明确规定全勤奖严格依据实际出勤天数发放，且该制度经过民主程序制定、内容合法并已向员工公示，则公司在工伤期间可能会依据此规定扣除全勤奖。然而，这种扣除可能引发争议，因为工伤停工是法律赋予的权利，严格扣除可能与《工伤保险条例》的立法精神相悖。

三、实际操作与建议

1. 查阅公司规定：首先，您应仔细查阅所在公司的相关规章制度或劳动合同，了解全勤奖的具体发放条件及工伤期间的待遇规定。

2. 与公司协商：如对公司规定有疑问或认为不合理，建议与公司的人力资源部门或相关负责人进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。在协商过程中，您可以引用《工伤保险条例》的相关规定，强调工伤期间原工资福利待遇不变的原则。

3. 法律途径：若协商无果，您可以依法通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。在此过程中，我将作为您的专业律师，为您提供必要的法律支持和协助。

四、特殊情况处理

值得注意的是，有些公司出于人道主义关怀和员工福利的考虑，可能会在工伤期间继续发放全勤奖或其他形式的补贴。这种情况下，您应珍惜并感激公司的关怀，同时遵守公司的相关规定。

总结来说，工伤请假期间全勤奖的扣除与否并非一概而论，而是需综合考虑法律法规、公司规章制度及实际情况。在处理此类问题时，建议您保持理性、公正的态度，与公司进行积极沟通协商，共同寻求合理合法的解决方案。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。