结论前置：在符合《中华人民共和国民法典》继承编规定的前提下，父母通过合法有效的遗嘱将遗产只留给儿子是合法的。但需注意，遗嘱必须为缺乏劳动能力又没有生活来源的继承人保留必要的遗产份额，且必须符合法律规定的形式要件和实质要件。以下是对此问题的详细分析：
法律角度分析
遗嘱继承的优先性：
- 根据《中华人民共和国民法典》继承编，自然人可以立遗嘱处分个人财产，并指定由法定继承人中的一人或数人继承。这意味着，父母有权通过遗嘱明确表示将遗产只留给儿子，这种处分行为在法律上是允许的。
- 遗嘱继承优先于法定继承。因此，在有效遗嘱存在的情况下，遗产将按照遗嘱进行分配，而不是按照法定继承顺序。
遗嘱的合法性与形式要求：
- 遗嘱必须符合法律规定的形式要件和实质要件。例如，自书遗嘱需要由遗嘱人亲笔书写、签名，并注明年、月、日；代书遗嘱则需要有两个以上见证人在场见证，并由遗嘱人、代书人和其他见证人签名，注明年、月、日。
- 如果遗嘱不符合这些法定形式，可能会被认定无效，进而按照法定继承处理遗产。
考虑特殊继承人的权益：
- 遗嘱必须为缺乏劳动能力又没有生活来源的继承人保留必要的遗产份额。如果女儿或其他法定继承人属于这种情况，而父母遗嘱未给其保留必要份额，那么在处理遗产时，应当先为该继承人留下必要的遗产。
- 除了子女外，还可能存在其他法定继承人，如配偶、父母等。在分配遗产时，也需要考虑到这些继承人的权利。如果遗嘱违反了法定继承人的基本权益，可能会导致遗嘱部分或全部无效。
道德和社会观念角度分析
可能被认为不合理：
- 在现代社会倡导男女平等的大背景下，如果仅仅因为性别因素，父母就将财产只给予儿子而不给女儿，这种做法容易被认为违背了公平和平等的原则，可能引发家庭矛盾和社会争议。
存在一定合理性的情况：
- 如果存在特殊情况，如女儿已经在生活中获得了较多来自家庭的支持，而儿子相对在经济上更需要帮助；或者女儿对父母未尽到应有的赡养义务，而儿子一直陪伴照顾父母，那么父母基于这些综合考虑将财产多给或只给儿子，可能会被部分人认为有一定的合理性。
实际操作建议
确保遗嘱的合法性：
- 父母在订立遗嘱时，应确保遗嘱符合法律规定的形式要件和实质要件，以避免遗嘱被认定无效。
考虑所有继承人的权益：
- 在分配遗产时，父母应充分考虑所有继承人的权益，特别是缺乏劳动能力又没有生活来源的继承人，以确保遗嘱的公平性和合理性。
加强家庭沟通：
- 父母在订立遗嘱前，可以与所有子女进行沟通，了解他们的想法和需求，以减少因遗产分配问题引发的家庭矛盾。
总结与建议：父母只把遗产留给儿子在大多数情况下是合法的，但前提是必须遵守《中华人民共和国民法典》继承编的相关规定，确保遗嘱的合法性和有效性，并考虑到特殊继承人的权益。在处理遗产继承问题时，如有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。