三方就工程款结算打的欠条，在符合法律规定的情况下是合法的。以下从不同角度为您详细分析：

合法性基础

1. 意思表示真实：三方在自愿、平等的基础上，就工程款结算达成一致，并出具欠条，这是三方真实意思的表示，符合民事法律行为的基本构成要件。
2. 内容合法：欠条的内容必须合法，即不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。在工程款结算的情境下，欠条应明确载明欠款金额、欠款原因、还款期限等关键信息，且这些信息应真实、准确。
3. 形式合法：虽然欠条并非必须采用书面形式，但为了确保其证据效力，建议采用书面形式，并由三方签字或盖章确认。

潜在风险及防范

1. 欠条内容不明确：如果欠条内容模糊、不明确，可能导致三方在履行过程中产生争议。因此，在出具欠条时，应尽可能详细、准确地描述欠款金额、欠款原因、还款期限等关键信息。
2. 欠款人无力偿还：如果欠款人（即工程款的支付方）无力偿还欠款，可能导致债权人的权益受损。为了避免这种情况，债权人在出具欠条前，应对欠款人的信用状况、还款能力等进行充分评估。
3. 法律程序风险：如果三方在履行欠条过程中产生争议，可能需要通过法律程序解决。因此，在出具欠条时，应明确约定争议解决方式（如仲裁或诉讼），并了解相关法律程序的规定。

实际操作建议

1. 明确欠款金额和原因：在欠条中详细列明欠款金额、欠款原因（如工程款未结算清等），以便在后续履行或争议解决过程中有据可查。
2. 约定还款期限和方式：明确约定还款期限和还款方式（如一次性还款或分期还款等），以避免因还款问题产生争议。
3. 保留相关证据：除了欠条外，还应保留与工程款结算相关的其他证据（如合同、结算单、付款凭证等），以便在需要时提供证明。
4. 及时咨询专业律师：如果在出具欠条或履行过程中遇到法律问题或争议，建议及时咨询专业律师，以便获得专业的法律建议和帮助。

总结来说，三方就工程款结算打的欠条在符合法律规定的情况下是合法的。但为了避免潜在风险，建议在出具欠条时明确欠款金额、原因、还款期限等关键信息，并保留相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。