结论：劳务分包结算劳务工资发生纠纷，一般不能直接申请劳动仲裁，但需根据具体情况判断是否涉及劳动关系及劳动者权益保护问题。以下是对此问题的详细分析：
一、劳务分包合同的性质与劳动仲裁的适用范围
劳务分包合同的性质：
- 劳务分包合同是承包人与劳务分包人之间就劳务作业承包事宜签订的协议，双方在此合同中为平等的民事主体。这种合同关系属于民事合同关系，而非劳动关系。
劳动仲裁的适用范围：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条，劳动仲裁主要处理劳动者与用人单位之间因劳动关系产生的争议，如确认劳动关系、工资支付、社会保险等。劳务分包合同违约或结算纠纷，显然不属于劳动关系的范畴，因此不直接适用劳动仲裁。
二、不同情况下的处理方式
纯粹的劳务分包合同纠纷：
- 如果纠纷仅涉及劳务分包合同的履行、结算等民事问题，双方应首先尝试通过友好协商或第三方调解的方式解决。
- 若协商和调解均无法达成一致，受害方可以向有管辖权的人民法院提起诉讼，依据《中华人民共和国民法典》的相关规定，要求违约方承担继续履行、采取补救措施或赔偿损失等民事责任。
涉及劳动者权益的情况：
- 如果劳务分包合同涉及劳动者权益被侵害，如拖欠农民工工资，且农民工作为劳动者能够证明与相关用人单位存在事实劳动关系，那么农民工作为劳动者可以就工资支付等劳动权益问题申请劳动仲裁。
- 在这种情况下，劳动仲裁将针对劳动者与用人单位之间的劳动关系争议进行审理，而非劳务分包合同本身的纠纷。
三、特殊情况的仲裁
- 如果劳务分包合同中有明确且有效的仲裁条款，双方可以按照仲裁条款的约定向仲裁机构申请仲裁。但这种情况较为特殊，需要合同中有明确的仲裁约定，并非常规处理方式。
四、法律建议
明确合同性质与关系：
- 在签订劳务分包合同时，应明确合同的性质及双方的权利义务关系，避免产生不必要的纠纷。
及时保留证据：
- 在发生纠纷时，应及时保留相关证据，如合同、结算单、付款凭证等，以便在协商、调解或诉讼过程中维护自己的合法权益。
寻求专业法律帮助：
- 如果对劳务分包合同纠纷的处理方式不确定或遇到复杂情况，建议及时向我咨询，以便获得更具体的法律建议和帮助。
总结：劳务分包结算劳务工资发生纠纷时，一般不能直接申请劳动仲裁，但需根据具体情况判断是否涉及劳动关系及劳动者权益保护问题。在处理此类纠纷时，应明确合同性质与关系、及时保留证据，并在必要时寻求专业法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。