结论：不认识的人用手机转了两笔钱到公司账上，一般情况下应当退回去，且不退还可能面临一定的法律风险。以下从不同角度进行详细分析：
一、为何应当退还
不当得利原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，没有合法根据，取得不当利益，造成他人损失的，应当将取得的不当利益返还受损失的人。在此情况下，公司收到不认识的人的转账，若无法证明该款项有合法依据（如合同约定、债务清偿等），则构成不当得利，应当退还。
避免法律纠纷：
- 若公司不退还该款项，转账人可能会以不当得利为由向法院提起诉讼，要求公司返还。这不仅会给公司带来诉讼成本，还可能影响公司的声誉和正常运营。
二、不退还可能面临的法律风险
民事诉讼风险：
- 如前所述，转账人可能会以不当得利为由向法院提起诉讼。若法院认定公司构成不当得利，公司需承担返还义务，并可能需支付诉讼费用等额外成本。
刑事风险（极端情况下）：
- 在极少数情况下，如果公司明知该款项来源非法（如诈骗、洗钱等）而故意不退还，甚至协助转账人进行资金转移或隐匿，则可能构成共同犯罪或掩饰、隐瞒犯罪所得罪等刑事犯罪。虽然这种情况较为极端，但公司仍需保持警惕，避免陷入法律风险。
三、建议操作流程
核实款项来源：
- 公司应首先核实该两笔款项的来源和性质，确认是否与公司有业务往来或合同关系。可以通过联系转账人、查询银行流水等方式进行核实。
与转账人沟通：
- 若核实后确认该款项与公司无关，公司应主动与转账人联系，说明情况并要求其提供正确的收款账户信息，以便将款项退还。
保留证据：
- 在整个过程中，公司应保留好相关证据，如银行流水、转账记录、与转账人的沟通记录等，以备不时之需。
及时退还：
- 一旦确认款项应退还，公司应尽快将款项退还至转账人指定的账户，并保留好退还凭证。
总结与进一步思考：公司收到不认识的人的转账时，应首先核实款项来源和性质，确认是否构成不当得利。若构成不当得利，公司应主动与转账人联系并退还款项，以避免法律纠纷和潜在的法律风险。若公司对该款项存在疑问或无法确认其来源，建议及时咨询专业律师或相关机构以获取更具体的法律建议。