当遇到发票比合同金额多开的情况时，这确实是一个需要谨慎处理的问题，因为涉及到税务合规和财务准确性。以下是我为您提供的详细处理指南及法律注意事项：

一、处理指南

1. 当月发现且双方未进行账务处理

• 增值税专用发票/增值税普通发票：

  • 如果您是开票方，应立即收回所有联次的发票。
  • 在开票系统中直接作废该发票，并重新按照合同上的正确金额开具新的发票。

• 纸质发票：

  • 您可以直接前往国税局申请作废该发票，并重新开具正确金额的发票。
  • 作废的发票需要妥善保管，并按照规定进行报备。

2. 跨月发现

• 受票方未认证抵扣（专票）或未入账（普票）/纸质发票对方未报税：

  • 增值税专用发票：您需要填写并上传《开具红字增值税专用发票信息表》至税务机关，经校验通过后，开具红字专用发票来冲减多开的金额，随后再重新开具正确金额的发票。
  • 增值税普通发票/纸质发票：您可以直接在开票系统中开具红字发票来冲减多开的金额，然后重新开具正确金额的发票。

• 受票方已认证抵扣（专票）或已入账（普票）/纸质发票对方已报税：

  • 增值税专用发票：由受票方在增值税发票综合服务平台中填开并上传《开具红字增值税专用发票信息表》，您凭校验通过的《信息表》开具红字专用发票冲减，并重新开具正确发票。同时，受票方需在当期进项税额中转出多抵扣的税额。
  • 增值税普通发票：双方需要协商，受票方出具相关证明后，您可以据此开具红字发票冲减，并重新开具正确金额的发票。
  • 纸质发票：需要由对方单位向其所在地国税局申请红字发票证明，获得后方可由您开具红字发票进行冲减，并重新开具正确金额的发票。

• 电子发票：

  • 电子发票一旦开具，暂不能作废。若金额多开，您只能开具红字增值税电子普通发票进行冲减，流程与纸质发票跨月处理类似。

二、法律注意事项

1. 遵循法律法规：在处理发票多开问题时，必须严格遵守相关的税收法律法规，确保所有操作都是合法合规的。

2. 保持良好沟通：与对方单位及税务机关保持密切沟通是非常重要的，这有助于您及时解决问题并获得必要的指导和帮助。

3. 妥善保管记录：对于所有作废、冲红及重新开具的发票，您应做好详细记录并妥善保管，以备税务机关日后检查。

4. 法律责任：多开发票是违法行为，可能面临严重的法律责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票，将受到刑事处罚。因此，您务必确保发票开具的准确性，避免触犯法律。

综上所述，处理发票比合同金额多开的问题时，您应根据具体情况采取相应的措施，并确保整个处理过程合法合规。这样不仅能维护您的合法权益，还能避免潜在的法律风险。如果您在处理过程中遇到任何困难或疑问，建议及时咨询专业的税务顾问或律师。