在计算补偿金时，如果应发工资和实际发放的工资数额一致，那么两者均可作为计算基数，因为此时两者数值相同，不影响最终结果。不过，为了更全面地解答这个问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：
一、应发工资与实际发放工资的定义
应发工资：指的是劳动者在正常工作时间内，按照劳动合同约定或国家规定应获得的全部劳动报酬，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等各项收入。
实际发放工资：指的是劳动者实际收到的工资数额，它可能因各种原因（如社保扣除、个人所得税扣除、其他代扣款项等）而少于应发工资。
二、补偿金计算基数的确定
在计算补偿金时，通常是以劳动者的月工资作为计算基数。这里的“月工资”一般指的是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。而在这个平均工资的计算中，理论上应使用应发工资作为计算基础，因为它反映了劳动者应得的全部劳动报酬。
然而，在实际操作中，如果应发工资和实际发放的工资数额一致，那么使用哪一个作为计算基数都不会影响最终结果。这是因为两者数值相同，所以计算出的补偿金数额也会相同。
三、特殊情况下的处理
如果存在代扣款项：如果劳动者的实际发放工资因社保扣除、个人所得税扣除等原因而少于应发工资，那么在计算补偿金时，应使用应发工资作为计算基数，以反映劳动者应得的全部劳动报酬。
如果劳动合同有特别约定：如果劳动合同中明确约定了补偿金的计算基数（如以基本工资为计算基数），那么应按照劳动合同的约定执行。但需要注意的是，这种约定不得违反法律法规的强制性规定。
四、法律依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条的规定：“经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。本条所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。”
五、建议
保留相关证据：劳动者在计算补偿金时，应保留好相关的工资条、劳动合同等证据，以便在发生争议时能够证明自己的权益。
咨询专业律师：如果劳动者对补偿金的计算存在疑问或争议，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见和帮助。
综上所述，如果应发工资和实际发放的工资数额一致，那么两者均可作为计算补偿金的基数。但在实际操作中，应根据具体情况和法律法规的规定来确定计算基数。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。