结论：在公安局委托司法鉴定公司进行印章印文真伪鉴定的情况下，鉴定费一般应由委托方即公安局承担，但具体费用承担可能因案件性质、合同约定或法律规定而有所不同。以下是对此问题的详细分析：
一、一般原则：委托方承担鉴定费
在司法实践中，当公安局作为委托方，委托司法鉴定公司进行印章印文真伪鉴定时，鉴定费通常由委托方即公安局承担。这是因为鉴定是公安局为了履行其侦查、调查等职责而进行的，是公安局工作的一部分，因此相关费用应由公安局预算中支出。
二、特殊情况：费用承担可能因案件性质、合同约定或法律规定而异
案件性质：
- 在某些特定类型的案件中，如民事纠纷中的印章真伪鉴定，如果鉴定结果对案件结果有直接影响，且双方当事人在合同中未明确约定鉴定费承担方式，那么根据公平原则，鉴定费可能由双方当事人共同承担或由败诉方承担。但在公安局委托的刑事案件或行政案件中，这种情况较为少见。
合同约定：
- 如果公安局与司法鉴定公司之间签订了委托合同，并且合同中明确约定了鉴定费的承担方式，那么应按照合同约定执行。例如，合同可能规定鉴定费由公安局承担，或者由特定当事人承担（如在特定民事案件中）。
法律规定：
- 在某些特定情况下，法律可能明确规定鉴定费的承担方式。例如，在刑事诉讼中，如果鉴定是侦查机关为了查明案情而进行的，那么鉴定费通常由侦查机关（即公安局）承担。在行政诉讼中，如果鉴定是行政机关为了证明其行政行为的合法性而进行的，那么鉴定费也可能由行政机关承担。
三、实际操作建议
查阅合同：
- 如果公安局与司法鉴定公司之间签订了委托合同，首先应查阅合同条款，了解鉴定费的承担方式。
咨询相关部门：
- 如果合同中没有明确约定或法律规定不明确，可以咨询当地财政部门或司法行政部门，了解相关费用承担的政策和规定。
与当事人沟通：
- 在某些特殊情况下，如果鉴定费确实需要由当事人承担（如特定民事案件中），公安局应与当事人进行充分沟通，解释费用承担的原因和依据，并确保当事人了解并同意承担相关费用。
进一步思考：在实际操作中，鉴定费的承担方式可能因案件性质、地区差异、合同约定等多种因素而有所不同。因此，在处理具体案件时，应综合考虑各种因素，确保费用承担的公平性和合理性。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。