企业接受虚开的增值税专用发票是一个非常严肃的问题，这涉及到税收法律法规的违反，并可能带来一系列严重的法律后果。以下是我为您详细梳理的处理流程和相关建议：

一、法律后果概览

企业接受虚开发票，首先可能面临的是补缴税款及滞纳金。如果发票已被用于抵扣进项税额或税前扣除，税务机关会要求企业转出这些进项税额，并补缴相应的增值税和企业所得税。此外，根据《中华人民共和国税收征收管理法》的相关规定，企业还可能因偷税行为受到行政处罚，罚款金额通常为不缴或少缴税款的百分之五十以上五倍以下。更为严重的是，如果接受虚开发票的行为达到刑法规定的标准，企业还可能面临刑事处罚，包括有期徒刑和罚金等。

二、具体处理步骤

1. 立即停止违法行为：

   • 企业一旦发现或怀疑接受了虚开发票，应立即停止使用这些发票，并停止与提供虚开发票的相关方的任何业务往来。

2. 配合税务机关调查：

   • 企业应积极配合税务机关的调查工作，如实提供所需资料和信息，包括发票的来源、用途、抵扣情况等，以协助税务机关尽快查清事实真相。

3. 自查整改：

   • 企业应对自身的财务管理和内部控制进行全面自查，找出存在的问题和漏洞，并立即进行整改。特别是要加强发票管理制度，确保所有发票的合法性和真实性。
   • 同时，企业还应加强员工培训，提高员工对税收法律法规的认识和遵守意识，防止类似问题再次发生。

4. 承担法律责任：

   • 如果企业确实存在违法行为，应主动向税务机关报告，并依法补缴税款、缴纳罚款等，承担相应的法律责任。这是企业诚信经营和合法发展的基础。

5. 寻求专业帮助：

   • 在处理此类问题时，企业可能会面临复杂的法律问题和税务争议。因此，建议企业咨询专业律师或税务顾问，以获得专业的法律咨询和协助。他们可以帮助企业更好地理解税收法律法规，提供合规建议，并在必要时代表企业进行申诉或辩护。

三、特殊情况处理

• 如果企业有证据证明对取得的虚开发票并不知情，且属于善意取得，那么根据相关规定，如果企业能重新从销售方取得合法、有效的专用发票，那么准予抵扣进项税款。否则，企业可能需要追缴已抵扣的进项税款。

四、总结与建议

企业接受虚开发票的法律后果严重，不仅可能面临补缴税款、行政处罚和刑事处罚，还可能影响企业的纳税信用等级和声誉。因此，企业必须高度重视这一问题，加强财务管理和内部控制，确保所有业务活动的合法性和合规性。同时，企业还应积极寻求专业帮助，以降低法律风险并维护自身的合法权益。