结论：公司工资发一半是否违法，需根据具体情况综合判断。在大多数情况下，若没有合理合法原因，公司只发放一半工资是违法的；但在某些特殊情况下，如双方协商一致或存在法定扣除情形，且剩余工资不低于最低工资标准，则可能不构成违法。
合法的情况
双方协商一致：
- 若公司与劳动者经过平等协商，达成一致意见，如劳动者因个人原因提出先领取一半工资，且公司同意，此情况视为双方在自愿、平等的基础上对工资支付方式进行了变更，因此是合法的。但这种情况较为少见，且需要明确的书面协议作为依据。
法定扣除情形：
- 公司可在法律允许的范围内代扣费用，如个人所得税、社会保险费用等。但扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。若扣除后剩余工资仍不低于最低工资标准，则此情况是合法的。例如，若劳动者月工资为5000元，扣除社保和个人所得税后剩余4500元，而当地最低工资标准为2000元，则公司发放4500元是合法的。
经营困难与工资调整：
- 企业因自然灾害、战争等非人力所能抗拒的原因无法按时支付工资，或因生产经营困难、资金周转受影响而暂时延期支付工资（最长不得超过30日），并在征得本单位工会同意后与劳动者协商一致，先发放一半工资，待经营状况好转后再补发剩余部分，此情况在法律允许范围内。但这种情况需要严格的程序和条件，且需及时补发剩余工资。
违法的情况
无故克扣工资：
- 若公司无合理合法原因，只发放一半工资，即构成克扣工资，违反了《中华人民共和国劳动法》第五十条和《中华人民共和国劳动合同法》第三十条的规定。劳动者在遭遇此类情况时，有权依法向当地人民法院申请支付令，要求公司支付应得的全部工资。
低于最低工资标准：
- 若公司发放的工资低于当地最低工资标准，即使双方有口头或书面协议，也是违法的。例如，若当地最低工资标准为2000元，而公司只发放1000元，则构成违法。
逃避纳税义务：
- 若公司分两部分发工资主要为了逃避个税或其他税费，如以现金、实物等形式发放部分工资，不纳入工资核算和纳税申报，即构成违法。这种行为不仅违反了税收法规，也损害了劳动者的合法权益。
综合判断与建议
判断公司工资发放方式是否违法，需综合考虑劳动合同约定、工资支付总额与时间、税收合规性等多个因素。若对公司工资支付方式有疑问或担忧，建议采取以下措施：
- 与公司沟通：首先尝试与公司沟通，了解工资发放的具体原因和依据，看是否能够达成一致意见。
- 收集证据：若沟通无果，收集相关证据，如工资条、银行流水、劳动合同等，以备后续维权使用。
- 寻求法律帮助：若认为公司行为违法，可向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见和帮助。
总之，公司工资发一半是否违法需根据具体情况综合判断。在维护自身合法权益的同时，也要了解公司的经营状况和困难，寻求合理的解决方案。