结论：奶茶店以迟到为由罚款200元的行为，在多数情况下是不合法的，员工有权拒绝不合理扣罚。以下是具体分析：

1. 从罚款主体合法性看
   根据《行政处罚法》第17条，只有行政机关或经法律授权的组织才能实施罚款。奶茶店作为普通用人单位，无权自行设定罚款制度，其“迟到罚款”缺乏法律依据。即使员工手册或劳动合同中有类似条款，也因违反法律强制性规定而无效。

2. 从扣罚金额合理性看
   即使假设罚款合法（实际不成立），根据《工资支付暂行规定》第16条，因员工过错造成损失的，用人单位扣款不得超过当月工资的20%，且扣除后工资不得低于当地最低工资标准。
   以日薪80元推算，月工资约2400元（按30天计），20%为480元。若迟到一次扣200元，单次扣罚已接近月工资的10%，若多次迟到可能导致工资低于最低标准（如当地最低工资为2000元/月），显然不合理。

3. 从劳动纪律管理角度看
   用人单位可通过合法方式管理考勤，例如：

• 将迟到与绩效挂钩，减少奖金而非直接罚款；
  
• 要求员工赔偿因迟到导致的实际损失（如外卖超时赔偿），但需举证损失金额；
  
• 在规章制度中明确“严重迟到”（如频繁迟到、影响经营）可作为解除劳动合同的依据，但需经民主程序公示。

建议行动：

1. 与雇主协商，要求出示罚款的法律依据及扣款明细；
   
2. 若协商无果，可向当地劳动监察大队投诉（电话12333），或申请劳动仲裁主张返还罚款；
   
3. 保留工资条、考勤记录、罚款通知等证据，以便维权。
   

温馨提示：劳动法旨在平衡劳资关系，若遇到其他扣薪、加班、工伤等问题，欢迎随时向我咨询具体应对方案。