针对您提出的公司搬迁纠纷处理问题，这是一个涉及劳动法、合同法以及劳动争议解决机制的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、理解搬迁纠纷的本质
公司搬迁纠纷通常源于公司因业务发展、城市规划等原因需要迁移办公地点，而这一变动可能影响到员工的通勤、生活成本等，从而引发员工与公司之间的争议。核心问题在于搬迁是否构成对劳动合同的实质性变更，以及员工在此情况下的权益保护。
二、法律依据与权利义务
劳动合同变更：根据《劳动合同法》的规定，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。若搬迁导致工作地点、工作条件等发生重大变化，构成对劳动合同的实质性变更，应提前与劳动者协商并征得同意。
经济补偿：若劳动者因搬迁不愿继续履行劳动合同，根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位应按劳动者在本单位工作的年限，支付经济补偿。具体标准为每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资。
劳动保障监察：根据《劳动保障监察条例》，劳动保障行政部门对用人单位遵守工作时间和休息休假规定、支付劳动者工资等情况实施监察。若公司搬迁过程中存在违法行为，员工可向劳动保障行政部门投诉。
三、纠纷处理途径
协商解决：首先，建议员工与公司进行友好协商，尝试达成双方都能接受的解决方案。这可以包括调整工作时间、提供交通补贴、协商经济补偿等。
劳动争议调解：若协商不成，员工可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解。调解委员会会组织双方进行调解，力求达成和解协议。
劳动仲裁：若调解不成，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁委员会会依法进行裁决，裁决结果具有法律效力。员工应向劳动合同履行地或单位注册地的劳动人事争议调解仲裁委员会申请仲裁。
诉讼：对仲裁裁决不服的，员工可以向人民法院提起诉讼。法院会依法进行审理，并作出最终判决。
四、实际操作建议
收集证据：在处理纠纷过程中，员工应收集相关证据，如劳动合同、搬迁通知、通勤记录等，以证明自己的主张。
了解政策：员工应了解相关法律法规和政策，明确自己的权益和义务，以便在协商和仲裁过程中更有底气。
寻求专业帮助：若纠纷复杂或难以解决，员工可以寻求律师或法律援助机构的帮助，以维护自己的合法权益。
五、案例参考
以浙江省衢州智造新城人民法院处理的某新材料公司与食品公司房屋租赁合同纠纷为例，法院通过启动涉企纠纷快速响应机制，组织多次调解，最终促成双方达成“租金减免﹢分期补偿﹢限期腾退”的解决方案。这一案例展示了通过法律途径和调解机制解决搬迁纠纷的有效性。
综上所述，处理公司搬迁纠纷需要员工了解自己的权益和义务，通过协商、调解、仲裁或诉讼等途径来维护自己的合法权益。希望以上解答能对您有所帮助。