结论：老板拖欠农民工工资三年多后打了欠条，农民工起诉的话，主要涉及诉讼时效、欠条的法律效力以及可能的赔偿问题。以下是对这些问题的详细分析。
一、诉讼时效问题
一般诉讼时效：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间一般为三年。这意味着，从权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算，三年内应提起诉讼。
诉讼时效的中断与重新计算：
- 如果在诉讼时效期间内，农民工向老板主张过权利（如讨要工资），或者老板出具了欠条等书面文件确认债务，这通常会导致诉讼时效的中断，并重新计算三年。因此，如果欠条是在三年内出具的，或者出具欠条后农民工又进行了主张，那么诉讼时效可能并未过期。
二、欠条的法律效力
欠条作为证据：
- 欠条是老板承认拖欠工资的书面证据，具有法律效力。在起诉时，农民工可以将欠条作为关键证据提交给法院，以证明老板拖欠工资的事实。
欠条的内容要求：
- 欠条应明确载明拖欠的工资数额、拖欠的时间、老板的身份信息以及还款期限等关键信息。如果欠条内容不完整或存在歧义，可能会影响其法律效力。
三、起诉与赔偿问题
起诉流程：
- 农民工可以携带欠条、身份证明等相关证据，向有管辖权的人民法院提起诉讼。法院将依法审理案件，并作出判决。
赔偿问题：
- 如果法院判决老板支付拖欠的工资，老板应履行判决义务。如果老板拒不履行，农民工可以申请法院强制执行。
- 在某些情况下，农民工还可以要求老板支付逾期利息或赔偿金等额外费用。这取决于具体案件情况和法院的判决。
四、特殊情况考虑
如果欠条已过诉讼时效：
- 如果欠条出具时间已超过三年，且没有诉讼时效中断或重新计算的情况，那么农民工的起诉可能会面临诉讼时效过期的风险。此时，农民工可以尝试与老板协商解决，或者寻求其他法律途径（如申请劳动仲裁等）来维护自己的权益。
如果老板下落不明或无力支付：
- 如果老板下落不明或确实无力支付拖欠的工资，农民工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。在劳动仲裁或诉讼过程中，农民工可以申请财产保全等措施来保障自己的权益。
建议：农民工在遇到此类问题时，应及时收集并保存好相关证据（如欠条、工作记录、工资条等），并尽快向有管辖权的人民法院提起诉讼或申请劳动仲裁。如果对法律程序不熟悉或担心自己的权益得不到保障，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。