农村有土地证的房屋买卖是否合法，需根据具体情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：

一、合法的情况

1. 同村村民之间的买卖

   • 法律依据：根据《中华人民共和国土地管理法》第六十二条，宅基地可以在本集体经济组织内部流转，即同村村民之间可以进行房屋买卖。
   • 条件：买卖双方必须均为本村村民，且买方需符合“一户一宅”的规定，即未拥有其他宅基地。
   • 举例：张某（本村村民）将房屋卖给李某（同村村民），且李某之前未拥有宅基地，此买卖合法。

2. 房屋所使用的土地性质为国有土地

   • 法律依据：若农村房屋所使用的土地性质为国有土地，则其流转规则更接近于城市国有土地上房屋的流转，受《中华人民共和国民法典》和《中华人民共和国城市房地产管理法》等法律法规约束。
   • 条件：手续齐全、产权清晰的情况下，这类房屋通常可进入市场交易，且交易主体无严格限制，买受人可以是本集体经济组织以外的自然人、法人或其他组织。
   • 举例：某农村地区因历史原因，部分房屋所占土地为国有土地，这些房屋在手续齐全的情况下可以合法买卖。

二、不合法的情况

1. 卖给非本集体经济组织成员

   • 法律依据：宅基地属于农民集体所有，非本集体经济组织成员不具备取得宅基地使用权的资格。
   • 后果：此类买卖合同通常被认定为无效，可能导致法律纠纷和财产损失。
   • 举例：城里人王某购买农村赵某的房屋，因王某非本村村民，该买卖合同无效。

2. 违反“一户一宅”规定的买卖

   • 法律依据：《中华人民共和国土地管理法》等法规强调“一户一宅”原则，即每户只能拥有一处宅基地。
   • 后果：违反此规定的买卖行为不受法律保护，可能面临处罚或强制恢复原状。
   • 举例：村民孙某已有一处宅基地，再购买同村另一处房屋，因违反“一户一宅”规定，该买卖不合法。

3. 未经法定程序和审批的买卖

   • 法律依据：农村房屋买卖需遵循一定的法定程序，如办理宅基地使用权变更登记等手续。
   • 后果：未按规定程序进行审批和登记的买卖行为可能存在合法性问题，可能导致合同无效或产生法律纠纷。
   • 举例：陈某和刘某私下达成农村房屋买卖协议，未向村集体经济组织报告且未办理相关变更登记手续，该买卖在法律上存在瑕疵。

4. 房屋存在权利瑕疵

   • 情况说明：若房屋存在抵押、查封等权利受限情况，在抵押解除或查封措施撤销之前，不得进行买卖交易。
   • 举例：某房屋因债务纠纷被法院查封，此时该房屋不得进行买卖。

三、建议与注意事项

• 确认土地性质和房屋产权：在进行农村房屋买卖前，务必确认土地的性质和房屋的产权情况，确保交易合法合规。
• 遵守交易程序：农村房屋买卖需遵循一定的法定程序，如签订书面买卖合同、缴纳相关税费、办理房屋所有权和土地使用权的变更登记手续等。
• 咨询专业意见：由于农村房屋买卖涉及复杂的法律问题，建议在进行交易前咨询专业律师，以获取准确的法律意见和指导。

总结来说，农村有土地证的房屋买卖是否合法，取决于买卖双方的身份、宅基地使用规定以及交易程序的合规性。在进行交易前，务必了解清楚相关法律法规和政策要求，确保交易的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。