结论：国企在已与合作公司签署合作协议后继续商务接待是否违规，需结合具体情境判断，包括接待目的、费用承担、是否符合内部规定及是否涉及利益输送等因素。以下从不同角度进行分析：

1. 合规性角度：

   • 若商务接待符合国企内部规定及行业惯例：国企在合作过程中进行必要的商务接待，如为了推进项目进展、加强沟通合作等，且接待费用由国企按照内部财务制度承担，未超出合理范围，也未违反相关法律法规及国企内部规定，则通常不视为违规。
   • 若商务接待超出合理范围或违反规定：例如，接待费用过高、接待对象不符合规定、接待活动涉及不正当利益输送等，则可能构成违规。此时，国企及相关责任人员可能面临内部纪律处分，甚至可能触犯法律，如贪污受贿等。

2. 合作协议内容角度：

   • 若合作协议中有明确约定：如合作协议中明确规定了商务接待的范围、标准、费用承担等条款，则国企应严格按照协议约定执行。若国企违反协议约定进行商务接待，则可能构成违约，需承担相应的违约责任。
   • 若合作协议中未明确约定：则国企在商务接待方面应遵循相关法律法规及国企内部规定，确保接待活动的合规性。

3. 利益输送与腐败风险角度：

   • 需警惕利益输送：国企在商务接待过程中，应特别注意避免与合作伙伴之间存在不正当的利益输送。例如，通过高规格接待、赠送贵重礼品等方式，为合作伙伴谋取不正当利益，或为自己谋取私利。
   • 腐败风险防控：国企应建立健全腐败风险防控机制，加强对商务接待活动的监督和管理。对于涉嫌违规的商务接待活动，应及时进行调查处理，并依法追究相关责任人员的责任。

法律建议：

• 国企在商务接待前，应仔细审查合作协议内容，确保接待活动符合协议约定。
• 国企应制定并执行严格的商务接待管理制度，明确接待范围、标准、费用承担等事项，确保接待活动的合规性。
• 国企应加强对商务接待活动的监督和管理，定期对接待活动进行审计和检查，及时发现并纠正违规行为。
• 若国企在商务接待过程中发现涉嫌违规或腐败的行为，应及时向相关部门报告，并配合调查处理。

可能后果：

• 若国企商务接待违规，可能面临内部纪律处分，如警告、记过、降职等。
• 若违规行为情节严重，可能触犯法律，如贪污受贿等，相关责任人员将面临刑事责任的追究。
• 违规行为还可能对国企的声誉和形象造成负面影响，影响其与合作方的长期合作关系。

如有具体情境或疑问，可直接向我咨询，我将结合具体情况提供更详细的法律分析。