结论：从法律和实务操作角度，您已通过微信发送辞职信的行为在法律上可视为有效通知，但为避免后续争议，建议结合书面离职申请流程完善手续。以下是具体分析：

1. 法律层面：微信辞职的效力

根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前30日（试用期3日）以书面形式通知用人单位，即可解除劳动合同。

• 关键点：法律未强制要求“书面形式”必须为纸质文件，电子数据（如微信、邮件）在符合条件时可视为书面形式。
  
• 条件：需满足“可证明性”（如微信记录未删除、对方确认收到）和“明确性”（内容需包含离职意愿、时间等核心信息）。
  
• 风险：若公司否认收到微信或质疑内容真实性，您可能需举证（如截图、聊天记录等），存在一定不确定性。

2. 实务操作：公司要求离职申请的合理性

公司要求填写离职申请表，通常出于以下目的：

• 内部流程管理：便于统计离职原因、安排工作交接、核算薪资等；
  
• 风险规避：避免因通知形式不规范引发劳动争议（如未留存证据）。
  
• 建议：若公司坚持要求，您可配合填写，但需注意：
  
  • 在申请表中明确离职日期（与微信通知一致）；
    
  • 保留申请表的复印件或拍照留存；
    
  • 要求人事在微信或邮件中确认收到申请表（作为双重证据）。

3. 行动建议：如何平衡法律与实务需求

• 优先选择：若公司态度强硬，建议同步操作：
  
  1. 微信再次发送辞职通知（注明“此通知与此前发送内容一致”）；
     
  2. 填写离职申请表并留存证据；
     
  3. 口头向直属领导说明离职计划（录音或找同事见证）。
     
• 底线原则：无论采用何种形式，务必确保离职日期清晰、不可撤销，避免公司以“未收到通知”为由拖延或拒绝办理手续。

4. 特殊情况处理

• 公司拒不办理离职：若超过30日仍不放行，您可向劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁，要求确认劳动关系解除并办理离职手续。
  
• 微信记录丢失：立即通过其他方式补发通知（如邮件、短信），并保留发送记录。

总结：微信辞职在法律上有效，但为减少纠纷，建议配合公司流程完善手续。若遇公司刁难或权益受损，可进一步向我咨询具体应对方案。