当您在起诉过程中遇到公司合并的情况时，诉讼程序并不会因此中断，而是会依据相关法律法规进行相应调整，确保您的合法权益得到保障。 以下是具体分析和建议：
一、法律依据与合并方式
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》第六十七条，法人合并的，其权利和义务由合并后的法人享有和承担。
- 《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释也规定，作为当事人的法人或其他组织发生合并、分立或终止的，由承受其权利义务的法人或其他组织作为当事人继续诉讼。
合并方式：
- 吸收合并：一个公司吸收其他公司，被吸收的公司解散。
- 新设合并：两个以上公司合并设立一个新的公司，合并各方解散。
二、诉讼程序中的处理方式
及时通知法院：
- 您或其他知晓情况的诉讼参与人有义务及时将被告公司合并的情况告知法院。
- 法院会核实公司合并的相关事实，并要求提供合并的证明文件，如合并协议、工商变更登记资料等。
变更被告主体：
- 法院核实情况后，会依法变更诉讼主体，将合并后的公司列为被告继续进行诉讼。
- 合并后的公司取代原被告公司在诉讼中的地位，承担原被告公司的诉讼权利和义务。
三、实体权利义务的承担
债务承担：
- 合并后的公司要对原被告公司的债务承担责任，包括未履行的债务。
- 例如，若原被告公司欠您的货款，合并后的公司有义务按照原合同约定或法律规定支付。
抗辩权延续：
- 合并后的公司继承原被告公司在诉讼中享有的抗辩权。
- 如果原被告公司对您的主张有合理的抗辩理由，合并后的公司可以继续在诉讼中提出。
债权人的权利保护：
- 根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，债权人自接到通知书之日起三十日内，或未接到通知书的自公告之日起四十五日内，可以要求公司清偿债务或提供相应的担保。
- 合并后的公司应妥善处理与原公司相关的债权债务问题，确保债权债务关系的连续性和稳定性。
四、实际操作建议
收集证据：
- 保留所有与诉讼相关的证据，包括合同、交易记录、通信记录等，以证明您的权益。
关注合并进展：
- 密切关注被告公司的合并进展，确保及时获取合并协议、工商变更登记资料等关键文件。
与法院保持沟通：
- 及时与法院沟通，提供合并的相关信息，确保诉讼程序顺利进行。
考虑法律后果：
- 合并后的公司可能具有更强的经济实力和法律资源，因此您需要充分评估诉讼风险，并考虑是否需要调整诉讼策略。
总结来说，当您在起诉过程中遇到公司合并的情况时，不必过于担心诉讼程序的中断。合并后的公司会承继原被告公司的诉讼地位和相关权利义务，继续完成诉讼程序。您只需密切关注合并进展，及时与法院沟通，并收集好相关证据，以确保您的合法权益得到保障。 如果您有任何进一步的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。