工资里包含加班补贴在符合一定条件下是合法的，但关键在于劳资双方是否有明确且合理的约定，以及用人单位是否依法支付。以下是对此问题的详细分析：
合法情况
明确约定与足额支付：
- 用人单位与劳动者在劳动合同中必须明确约定工资构成中包含加班补贴，且对加班补贴的计算基数、方式等有清晰、具体的条款。该约定不得违反法律法规的强制性规定，如《劳动法》中关于加班费计算的标准和限额。
- 用人单位需按照约定的计算方式和标准，足额支付不低于法定标准的加班工资。例如，若劳动合同中约定了固定的加班补贴数额，实际支付的加班费用应与此相符或更高，且折算后的正常工作时间工资不得低于当地最低工资标准。
特殊工时制度的依法审批：
- 对于实行不定时工作制或综合计算工时工作制等特殊工时制度的岗位，用人单位必须经过劳动行政部门的审批，并依法实行。
- 在特殊工时制度下，工资中可以包含一定的加班补贴，但用人单位仍需保障劳动者的休息休假权利和相应的劳动报酬权益。
不合法或可能引发争议的情况
约定模糊或未足额支付：
- 如果劳动合同中只是笼统地提及工资包含加班补贴，而未具体约定加班补贴的计算基数、方式等关键内容，这种约定是不明确的，容易引发纠纷。
- 即使劳动合同中有约定，但用人单位在实际支付时未按法定标准足额支付加班工资，也是不合法的。例如，采用过低的计算基数导致实际支付的加班工资远低于法定标准。
擅自包含加班补贴：
- 用人单位在未与劳动者协商一致的情况下，擅自将加班补贴包含在工资中而未单独列出，可能会引发劳动者的不满和争议。劳动者可能认为自己的加班补贴被克扣或无法明确区分正常工资和加班补贴的具体数额。
违反工时制度：
- 如果用人单位未依法实行特殊工时制度，却按照包含加班补贴的工资形式支付，且劳动者的工作时间严重超过法定标准工作时间，同时又未按照法定标准支付足额的加班工资，这种情况是不合法的。
注意事项与建议
- 明确约定：为避免纠纷，用人单位应在劳动合同中详细列明工资的构成，包括正常工资和加班补贴的具体数额或计算方式。
- 足额支付：用人单位应确保按照约定的计算方式和标准足额支付加班工资，不得低于法定标准。
- 保留证据：劳动者应妥善保留工资条等相关证据，以证明自己的工资构成和加班补贴的支付情况。
- 法律途径：如果发生争议，劳动者可以通过劳动仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。
举例说明：假设某劳动者与用人单位在劳动合同中明确约定，月薪为5000元，其中包含加班补贴1000元，且该加班补贴的计算方式符合法律规定（如平时加班按照不低于工资的150%支付，休息日加班按照不低于工资的200%支付，法定节假日加班按照不低于工资的300%支付），同时扣除加班补贴后，劳动者的正常工作时间工资不低于当地最低工资标准。在这种情况下，工资里包含加班补贴是合法的。
综上所述，工资中包含加班补贴在一定条件下是合法的，但关键在于是否符合法律规定和双方的明确约定。用人单位应依法行事，劳动者也应了解自己的权益并妥善保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。