结论：承包水库放养的鱼苗被盗，农村农业局并非直接的处理机构，但您可以向其咨询或寻求帮助以了解后续处理途径，更直接的方式是报警处理，同时，根据具体情况，您还可以考虑通过民事诉讼来维护自己的权益。以下是对此问题的详细分析：

1. 农村农业局的职责范围：

   • 农村农业局主要负责农业、农村和农民相关的政策制定、执行和监督，包括农业生产、农村经济发展、农村社会事务管理等方面。
   • 在鱼苗被盗的情况下，农村农业局虽然不直接处理盗窃案件，但可以提供相关的农业政策咨询、指导或协助您联系其他相关部门（如公安机关）来处理此事。

2. 报警处理：

   • 鱼苗被盗属于盗窃行为，直接侵犯了您的财产权。根据《中华人民共和国治安管理处罚法》或《中华人民共和国刑法》（视盗窃金额和情节严重程度而定），盗窃行为是违法的，应受到相应的法律制裁。
   • 因此，您应立即向当地公安机关报案，提供详细的情况说明和证据（如监控录像、目击者证言等），以便公安机关能够迅速展开调查并追回被盗鱼苗。

3. 民事诉讼途径：

   • 如果盗窃行为给您造成了经济损失，且无法通过公安机关追回全部或部分损失，您还可以考虑通过民事诉讼来维护自己的权益。
   • 在民事诉讼中，您可以要求盗窃者赔偿您的经济损失，包括鱼苗的成本、养殖成本以及因盗窃行为导致的其他间接损失。
   • 为了支持您的诉讼请求，您需要准备充分的证据，如购买鱼苗的发票、养殖记录、损失评估报告等。

4. 预防措施与建议：

   • 为了避免类似事件再次发生，建议您加强水库的安全管理，如安装监控设备、增加巡逻频次、设置警示标志等。
   • 同时，与当地村民建立良好的关系，提高他们的法律意识和道德观念，共同维护水库的安全和秩序。

后续行动建议：

• 首先，立即向当地公安机关报案，并提供详细的情况说明和证据。
• 其次，咨询农村农业局或其他相关部门，了解是否有其他支持或协助措施可供利用。
• 最后，根据案件进展和损失情况，考虑是否需要通过民事诉讼来维护自己的权益。

如果您在处理此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。