在刑事案件中，若扣押的手机中提取了电子数据，但手机本身不被认定为作案工具，该手机在符合一定条件下是可以归还的。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、法律依据与归还条件
《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定：
- 根据该法，对于与案件无关的物品，应当及时返还。手机若不被认定为作案工具，且其上提取的电子数据已作为证据使用或已固定，那么手机在法律上即被视为与案件无关的物品。
- 同时，该法也规定了扣押物品的保管和返还程序。在案件终结后，如果手机确实与案件无关，且没有其他需要继续扣押的理由，应当及时返还给原所有人。
归还的具体条件：
- 手机上的电子数据已被完整提取并作为证据使用，且该证据已得到法院或相关机关的认可。
- 手机本身未被损坏或改变其原始状态，且没有其他需要继续扣押的法定理由（如作为其他案件的证据等）。
- 案件已经终结，或者虽然案件未终结但手机确实与案件无关，且返还手机不会影响案件的进一步侦查或审理。
二、实际操作中的考虑因素
证据固定与保全：
- 在归还手机前，必须确保手机上的电子数据已被完整、准确地提取并固定，以防止数据丢失或被篡改。
- 如果手机上的电子数据是案件的关键证据，且存在被删除或修改的风险，那么可能需要继续扣押手机以确保证据的保全。
案件进展与侦查需要：
- 如果案件仍在侦查阶段，且手机可能包含与案件相关的其他信息或线索，那么可能需要继续扣押手机以协助侦查工作。
- 在案件终结后，如果手机确实与案件无关，且没有其他需要继续扣押的理由，那么应当及时返还给原所有人。
原所有人的权益保护：
- 在归还手机时，应当确保原所有人的合法权益得到保护。例如，如果手机被扣押期间产生了损坏或丢失，应当根据实际情况进行赔偿。
- 同时，应当告知原所有人在返还手机后，如果发现手机上的数据被篡改或丢失，可以及时向相关机关报告并寻求法律救济。
三、特殊情况下的处理
手机作为其他案件的证据：
- 如果手机虽然不被认定为当前案件的作案工具，但可能作为其他案件的证据，那么可能需要继续扣押手机并移交给相关机关。
原所有人存在违法行为：
- 如果原所有人存在与手机相关的违法行为（如非法获取、传播他人隐私信息等），那么可能需要依法对原所有人进行处理，并可能暂时不返还手机。
建议：在实际操作中，如果手机不被认定为作案工具且符合归还条件，原所有人可以向相关机关提出返还申请。相关机关在审查申请后，如果认为符合返还条件，应当及时返还手机。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。