公司要求员工将党组织关系转入公司，这一要求是否合法，需分情况讨论：
若公司具备党组织设置条件且要求合理：
- 根据《中国共产党章程》及相关规定，有正式党员三人以上的基层单位，应当成立党的基层组织。若公司符合这一条件，并依法设立了党组织，那么公司要求员工将党组织关系转入，作为加强党员管理、确保党员参加党组织活动的一种方式，是合法且合理的。这种情况下，员工应积极响应公司要求，履行党员义务。
若公司不具备党组织设置条件或要求不合理：
- 如果公司并未设立党组织，或者虽然设立了但要求员工转入党组织关系缺乏合理依据（如仅为了形式上的要求，而非实际管理需要），那么这一要求可能不合法。员工有权拒绝不合理的党组织关系转入要求，并可以向相关部门反映情况。
进一步分析：
- 合法性基础：党组织关系的转入通常基于党员的实际工作、生活情况，以及党组织的设置和管理需要。公司作为用人单位，虽然可以提出一定的管理要求，但这些要求必须符合法律法规和党的相关规定。
- 员工权益保护：员工在面对公司要求转入党组织关系时，应首先了解公司是否具备党组织设置条件，以及这一要求是否合理。如果认为要求不合理，员工有权提出异议，并可以通过与公司沟通、向党组织反映或寻求法律援助等方式维护自己的权益。
- 实际操作建议：对于公司而言，如果希望加强党员管理，应首先确保自身具备党组织设置条件，并明确转入党组织关系的具体目的和合理依据。对于员工而言，如果对公司要求有疑问或不满，应积极与公司沟通，了解情况并寻求解决方案。
总结与建议：
- 公司要求员工将党组织关系转入是否合法，取决于公司是否具备党组织设置条件以及这一要求是否合理。
- 员工在面对这一要求时，应了解相关法律法规和党的规定，维护自己的合法权益。
- 如果公司或员工对这一问题存在疑问或争议，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和解决方案。