结论：双方协议书盖上公司公章并不一定就具有法律效力，公章的有效性也需结合具体情况判断。以下从多个角度进行分析：
一、公章的法律意义
公章是公司对外表示意思的重要工具，具有法律效力。在协议书上加盖公司公章，通常意味着公司对该协议内容的认可和接受，是公司意志的体现。然而，公章的法律效力并非绝对，其有效性还需结合其他因素综合判断。
二、协议书法律效力的判断标准
主体资格：
- 协议双方必须具备相应的民事行为能力，即能够独立进行民事活动并承担民事责任。如果一方或双方不具备主体资格，如未成年人、无民事行为能力人等，则协议可能无效。
意思表示真实：
- 协议内容必须是双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形。如果协议是在一方被欺诈或胁迫的情况下签订的，那么该协议可能被撤销或认定为无效。
内容合法：
- 协议内容必须符合法律法规的规定，不得违反公序良俗或损害国家、集体、第三人的利益。如果协议内容违法，如涉及非法交易、赌博等，则协议无效。
形式要件：
- 除了加盖公章外，协议书可能还需要满足其他形式要件，如签字、日期等。这些形式要件也是判断协议书法律效力的重要因素。
三、公章有效性的判断
公章的真实性：
- 加盖的公章必须是公司真实有效的公章，而非伪造或变造的。如果公章是伪造的，那么协议书可能无效，且伪造公章者可能承担法律责任。
公章的使用权限：
- 加盖公章的人员必须具备使用公章的权限。如果加盖公章的人员未经授权或超越权限使用公章，那么该协议书可能对公司不产生法律效力。
公章的使用场合：
- 公章的使用必须符合公司的规定和惯例。如果公章被用于非公司业务或非正常场合，如个人借款、担保等，那么该协议书可能对公司不产生法律效力。
四、建议与风险提示
核实公章真实性：
- 在签订协议书前，务必核实对方公章的真实性，可以通过查询公司登记信息、联系公司法务部门等方式进行确认。
明确使用权限：
- 确保加盖公章的人员具备使用公章的权限，并要求其提供相关授权文件或证明。
审查协议内容：
- 仔细审查协议内容，确保其符合法律法规的规定和双方的真实意思表示。如有疑问或不确定之处，应及时咨询专业律师。
保留证据：
- 在签订协议书过程中，务必保留好相关证据，如聊天记录、邮件往来、签字样本等，以备不时之需。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据你的具体情况，为你提供专业、全面的法律服务。