结论：补充协议约定的管辖无效时，能否适用原合同管辖约定，需根据具体情况判断。一般来说，若补充协议无效不影响原合同中管辖条款的效力，且原合同管辖条款合法有效，则可以适用原合同管辖约定；但若原合同管辖条款本身存在问题或补充协议无效导致原合同相关条款需重新审视，则可能无法直接适用。

分析说明：

1. 补充协议与原合同的关系：

   • 补充协议通常是对原合同的补充或修改，其效力依赖于原合同的效力。若补充协议中的管辖约定因违反法律、行政法规的强制性规定或公序良俗而无效，这并不意味着原合同中的所有条款都无效。
   • 在管辖约定方面，如果补充协议无效，而原合同中的管辖条款并未受到补充协议的影响，且该条款本身合法有效，那么理论上可以适用原合同的管辖约定。

2. 原合同管辖条款的合法性：

   • 原合同中的管辖条款必须符合法律、行政法规的规定，且不得违反公序良俗。如果原合同中的管辖条款本身存在违法或无效的情形，那么即使补充协议无效，也不能直接适用原合同的管辖约定。
   • 例如，如果原合同中的管辖条款约定了由一个与合同履行地、被告住所地等均无关联的法院管辖，且该约定违反了级别管辖或专属管辖的规定，那么该条款就是无效的。

3. 补充协议无效对原合同管辖条款的影响：

   • 补充协议无效可能只是导致其中部分条款无效，而不影响原合同中其他条款的效力。但是，如果补充协议无效的原因与原合同中的管辖条款有直接关联，或者补充协议无效导致原合同中的相关条款需要重新审视，那么原合同的管辖条款也可能受到影响。
   • 例如，如果补充协议是因为对原合同中的管辖条款进行了违法修改而无效，那么原合同中的原管辖条款可能也需要根据法律规定进行重新确定。

4. 实际操作中的建议：

   • 在遇到补充协议约定的管辖无效时，首先应审查原合同中的管辖条款是否合法有效。
   • 如果原合同中的管辖条款合法有效，且未受到补充协议无效的影响，那么可以适用原合同的管辖约定。
   • 如果原合同中的管辖条款存在问题或受到补充协议无效的影响，那么应根据法律规定和案件具体情况，重新确定管辖法院。

特殊场景：

• 在某些特殊情况下，如合同中存在仲裁条款或双方对管辖有特别约定（且该约定合法有效），那么即使补充协议无效，也可能需要按照仲裁条款或特别约定来确定管辖。

后续行动建议：

• 如果您在处理具体案件时遇到此类问题，建议详细审查原合同和补充协议的相关条款，以及相关法律法规的规定。
• 如有必要，可以咨询专业律师（即向我咨询，我专注于经济纠纷、合同纠纷领域），以获取更具体的法律建议和帮助。