在施工合同中，支付金额超出合同约定并不直接等同于违规，但超出部分需有合法依据，否则可能涉及违约或不当得利等问题。具体来说，是否违规取决于超付的原因、双方约定以及相关法律法规的规定。以下从几个角度详细分析：
合同约定角度：
- 如果施工合同中明确约定了支付金额、支付方式和支付时间等条款，那么双方应严格按照合同约定履行。若支付金额超出了合同约定的100万，且没有合法的变更或补充协议作为依据，那么这种超付行为可能构成违约。违约方可能需要承担违约责任，如赔偿损失等。
变更或补充协议角度：
- 在施工过程中，由于设计变更、工程量增加等原因，双方可能会签订变更或补充协议来调整合同金额。如果超付部分是基于合法有效的变更或补充协议，并且该协议符合相关法律法规的规定，那么这种超付行为是合法的，不构成违规。
不当得利角度：
- 如果超付部分没有合法的依据，且接收方没有合法原因获得该利益，那么可能构成不当得利。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不当得利应当返还给受损方。因此，在这种情况下，超付方有权要求接收方返还超付的金额。
实际操作建议：
- 在支付过程中，建议双方保持密切沟通，确保支付金额与合同约定或变更协议一致。
- 如果确实需要超付，应签订书面协议明确超付的原因、金额和返还方式等条款，以避免后续纠纷。
- 在发生超付情况时，应及时收集相关证据（如支付凭证、变更协议等），以便在需要时维护自己的合法权益。
举例说明：假设施工合同中约定了支付金额为100万，但在施工过程中由于设计变更导致工程量增加，双方签订了变更协议将合同金额调整为120万。在这种情况下，如果支付金额超过了100万但未超过120万，并且有变更协议作为依据，那么这种超付行为是合法的。反之，如果没有变更协议作为依据而支付了超过100万的金额，则可能构成违约或不当得利。
总结来说，施工合同中支付金额超出合同约定并不直接违规，但需有合法依据。建议双方在支付过程中保持沟通并签订书面协议以明确权利义务关系。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。