有罪不诉的情况下，是否需要补发扣的工资，需分情况讨论：

1. 有罪不诉与工资扣发的法律关系

   • 有罪不诉：通常指的是检察机关在审查起诉阶段，认为犯罪嫌疑人的行为虽然构成犯罪，但因情节轻微、社会危害性不大或其他法定原因，决定不起诉。这并不意味着犯罪嫌疑人无罪，而是基于刑事政策或法律规定的考量，不追究其刑事责任。
   • 工资扣发：工资扣发通常与员工的违纪行为、工作表现或公司规章制度相关。在劳动关系中，雇主有权根据合法合理的规章制度对员工进行处罚，包括扣发工资。但这种处罚必须基于合法的前提和程序。

2. 有罪不诉对工资扣发的影响

   • 若工资扣发与刑事案件无关：如果工资扣发是基于员工的其他违纪行为或工作表现，与刑事案件的有罪不诉无直接关联，那么雇主无需因有罪不诉而补发工资。工资扣发的合法性应依据公司规章制度和劳动合同来判断。
   • 若工资扣发与刑事案件直接相关：如果工资扣发是因为员工被指控犯罪并被采取刑事强制措施（如拘留、逮捕等），而后续检察机关决定不起诉，那么员工有权要求雇主补发被扣发的工资。这是因为，在刑事强制措施期间，员工并未被定罪，其劳动权利应得到保护。雇主不得因员工被指控犯罪而非法扣发工资。

3. 法律建议与维权途径

   • 协商与沟通：首先，建议员工与雇主进行协商，明确工资扣发的原因和依据。如果雇主拒绝补发工资，员工可以要求雇主提供书面说明和证据。
   • 劳动仲裁：如果协商无果，员工可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求雇主补发工资并支付相应的经济补偿。劳动仲裁机构将根据双方提供的证据和法律规定进行裁决。
   • 法律诉讼：如果劳动仲裁结果不满意，员工还可以向法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。

4. 注意事项

   • 保留证据：员工在维权过程中应保留好与工资扣发相关的所有证据，如工资条、扣发通知、劳动合同等。
   • 及时行动：一旦发现工资被非法扣发，员工应及时采取行动，避免超过法定时效期间而丧失维权机会。

总结来说，有罪不诉的情况下是否需要补发扣的工资，取决于工资扣发的原因和依据。如果工资扣发与刑事案件无关，雇主无需补发；如果与刑事案件直接相关且雇主无法提供合法依据，员工有权要求补发。在维权过程中，员工应保留好相关证据并及时采取行动。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。