拆迁程序违法时，拆迁协议的效力需根据具体情况判断，可能有效、无效或可撤销。以下是对这一问题的详细分析：
一、协议有效情形
意思表示真实且不违反法律强制性规定：
- 若拆迁方与被拆迁方在签订协议时，双方均出于真实意愿，无欺诈、胁迫等不正当手段，且协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，则即使后续拆迁行为被认定为违法，该协议仍可能有效。例如，双方就补偿事宜充分协商后自愿签订协议，但因拆迁程序瑕疵（如未依法进行公告、听证）导致拆迁行为违法，这并不影响协议本身的效力。
当事人事后追认：
- 如协议签订过程中存在轻微瑕疵，但当事人在事后通过实际行为（如接受补偿款）对协议进行了追认，表明愿意继续履行，则该协议同样有效。
二、协议无效情形
以欺诈、胁迫手段订立且损害国家利益：
- 若拆迁方采用欺诈、胁迫手段使被拆迁人违背真实意思签订协议，且该协议损害了国家利益，则该协议无效。例如，拆迁方虚构国家重点工程建设需求，实则用于商业开发，欺骗被拆迁人签订协议。
恶意串通，损害国家、集体或第三人利益：
- 拆迁方与部分被拆迁人恶意串通，签订损害国家、集体或其他被拆迁人利益的协议，此类协议无效。例如，拆迁方给予少数被拆迁人不合理高额补偿，损害其他被拆迁人利益。
以合法形式掩盖非法目的：
- 拆迁方通过签订形式上合法的协议来掩盖其违法强拆、非法获取土地等非法目的，此类协议无效。例如，拆迁方签订看似正常的补偿协议，实则为了绕过法定拆迁审批程序。
违反法律、行政法规的强制性规定：
- 协议内容若违反法律、行政法规的强制性规定，如补偿标准明显低于法定最低标准，则该协议无效。此外，若拆迁方未取得合法拆迁许可即签订补偿协议，也违反拆迁相关法律的强制性规定，导致协议无效。
三、协议可撤销情形
因重大误解订立：
- 被拆迁人对协议重要内容（如补偿金额、安置方式）存在重大误解而签订协议，有权请求人民法院或仲裁机构撤销该协议。例如，被拆迁人误解拆迁政策，以为补偿已包含所有项目，实则未涵盖某些重要补偿项目。
显失公平：
- 协议订立时明显违反公平、等价有偿原则，一方利用优势或对方缺乏经验，致使双方权利义务明显失衡，受损害方有权请求人民法院或仲裁机构变更或撤销协议。例如，拆迁方利用被拆迁人缺乏拆迁知识，签订极低补偿协议，与市场价值相差悬殊。
法律建议
收集证据：
- 若发现拆迁程序违法或协议存在上述无效、可撤销情形，被拆迁人应尽快收集相关证据，包括拆迁通知书、补偿协议、房产证等文件资料，以及现场照片、录音录像等视听资料。
咨询专业律师：
- 在收集证据后，被拆迁人应咨询专业律师，对案件进行法律分析，确定协议的效力及维权策略。
启动法律程序：
- 根据律师的建议，被拆迁人可以在知道或应当知道撤销事由之日起一年内，向有管辖权的人民法院提起诉讼，请求撤销签订的拆迁协议；也可以依据具体情况，向仲裁机构申请仲裁。时间很关键，超过一年的除斥期间，撤销权就可能消灭，再想撤销协议就难了。
综上所述，拆迁程序违法时，拆迁协议的效力需根据具体情况综合判断。被拆迁人在面对此类协议时，应充分了解自身权益，必要时咨询我，通过法律途径维护自己的合法权益。