结论：公司要求交接工作但不出具纸质版辞退证明时，员工是否继续工作需分情况讨论。一般而言，若公司未明确解除劳动关系，员工需谨慎处理；若公司行为已构成违法解除，员工可依法维权并无需继续工作。以下从不同角度详细分析：
一、法律义务与劳动关系存续
辞退证明的法定义务：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十条，用人单位在解除或终止劳动合同时，必须出具解除或终止劳动合同的证明。这是公司的法定责任，不因其未出具而免除。
- 若公司未出具辞退证明，但已口头通知解除劳动关系，员工可要求公司出具书面证明，以确认劳动关系解除的事实。
劳动关系存续与工作义务：
- 在公司未明确解除劳动关系且未出具辞退证明的情况下，劳动关系理论上仍存续，员工有义务继续履行工作职责，直至劳动关系正式解除。
- 然而，若公司行为已构成违法解除（如未提前通知、未支付经济补偿等），员工可依法主张权利，并无需继续工作。
二、实际风险与应对策略
继续工作的风险：
- 若员工在公司未出具辞退证明的情况下擅自离岗，公司可能以违反规章制度为由进行纪律处分，甚至认定旷工，影响工资结算、离职手续办理及就业声誉。
- 因此，在未明确劳动关系状态前，员工需谨慎决定是否继续工作。
应对策略：
- 友好沟通：首先尝试与公司进行友好沟通，明确要求出具辞退证明，并说明其重要性及可能的法律后果。
- 书面确认：若公司拒绝出具辞退证明，员工可发送书面通知（如邮件、短信等）要求公司确认劳动关系解除，并保留相关证据。
- 法律途径维权：若沟通无果，员工可向劳动行政部门投诉，要求其责令公司改正；或向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，主张公司违法解除劳动关系并要求支付经济补偿。
三、特殊情况下的处理
公司违法解除：
- 若公司存在严重违法违规行为（如未按时足额支付工资、未依法缴纳社保等），且已明确表示解除劳动关系但未出具辞退证明，员工可依据相关法律规定主张公司违法解除，并要求支付赔偿金。
- 在此情况下，员工无需继续工作，但应依法采取措施维护自己的合法权益。
员工主动离职：
- 若员工因个人原因主动离职，但公司拒绝出具辞退证明（实际应为离职证明），员工仍需完成工作交接，并可要求公司出具离职证明。
- 若公司拒绝出具，员工可参照上述应对策略进行维权。
四、建议与总结
- 保留证据：在整个过程中，员工应保留与公司的沟通记录、工作交接单、工资条等相关证据，以备不时之需。
- 谨慎决策：在未明确劳动关系状态前，员工需谨慎决定是否继续工作，以避免不必要的法律风险和经济损失。
- 及时维权：若公司行为已构成违法解除或拒绝出具辞退证明，员工应及时采取法律措施维护自己的合法权益。
总结：公司要求交接工作但不出具纸质版辞退证明时，员工需根据具体情况判断是否继续工作。在未明确劳动关系状态前，建议员工保持冷静、保留证据，并通过友好沟通或法律途径维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。