核心结论：合同违法且受益人现在才知道的情况下，民事诉讼中损失赔偿的法律保护主要体现在以下几个方面，受益人可通过合法途径主张自身权益。

1. 确认合同违法性及自身受益人地位

   • 首先，要明确合同存在违法情形，这可能涉及违反法律法规的强制性规定、违背公序良俗等。例如，合同约定进行非法交易、逃避税收等行为。
   • 确定自己是合同违法情形下的受益人。受益人通常是指在合同违法过程中实际获得了利益的一方，这种利益可能是经济上的，也可能是其他方面的。比如，在一份违法分包的合同中，实际施工方如果获得了工程款等利益，就可能被认定为受益人。

2. 损失赔偿的法律依据

   • 《中华人民共和国民法典》相关规定：根据民法典，因一方违约造成对方损失的，损失赔偿额应当相当于因违约所造成的损失，包括合同履行后可以获得的利益；但是，不得超过违约一方订立合同时预见到或者应当预见到的因违约可能造成的损失。在合同违法的情况下，如果违法方给受益人造成了损失，受益人有权依据民法典要求违法方进行赔偿。例如，合同违法导致受益人预期的商业利益无法实现，受益人可以要求违法方赔偿这部分损失。
   • 过错责任原则：在民事诉讼中，一般遵循过错责任原则。即如果违法方存在过错，而受益人没有过错，违法方应当承担赔偿责任。如果受益人自身也存在一定过错，那么可能需要根据双方的过错程度来分担损失。比如，在一份违法借贷合同中，出借人明知借款用途违法仍出借资金，借款人使用资金进行违法活动导致出借人资金受损，此时双方可能都存在过错，法院会根据具体情况确定双方的责任比例。

3. 诉讼流程及注意事项

   • 收集证据：受益人需要收集能够证明合同违法以及自身损失的证据。证据可以包括合同文本、交易记录、沟通记录、证人证言等。例如，要证明合同违法，可以收集相关法律法规条文以及合同内容与法律法规相冲突的证据；要证明自身损失，可以提供财务报表、交易凭证等。
   • 确定管辖法院：根据民事诉讼法的规定，确定有管辖权的法院。一般来说，合同纠纷由被告住所地或者合同履行地法院管辖。受益人需要根据具体情况选择合适的法院提起诉讼。
   • 起诉与答辩：受益人向法院提交起诉状，明确诉讼请求、事实和理由。被告方会在规定时间内提交答辩状，对受益人的诉讼请求进行回应。在这个过程中，受益人要清晰、准确地阐述自己的主张，并提供相应的证据支持。
   • 庭审与判决：法院会安排庭审，双方在庭审中进行举证、质证和辩论。法院会根据双方提供的证据和陈述，依据法律规定作出判决。如果受益人胜诉，违法方应当在判决规定的期限内履行赔偿义务。

4. 其他保护途径

   • 协商和解：在诉讼之前或诉讼过程中，受益人可以尝试与违法方进行协商和解。通过友好协商，双方可以达成赔偿协议，这样可以节省时间和诉讼成本。例如，双方可以就赔偿金额、支付方式等达成一致，并签订和解协议。
   • 申请调解：受益人可以向相关调解组织申请调解，如人民调解委员会、行业调解组织等。调解组织会组织双方进行调解，促使双方达成调解协议。调解协议具有法律效力，如果违法方不履行，受益人可以向法院申请强制执行。

建议：如果你遇到合同违法且自身作为受益人遭受损失的情况，建议及时收集相关证据，确定合适的诉讼策略。在诉讼过程中，要遵循法律程序，积极维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。