结论：公司强制要求加班且以不加班为由扣除全勤奖的行为，其合法性需分情况讨论。在一般情况下，未经协商的强制加班及扣除全勤奖可能构成违法；但在特殊情况下或公司有合法且明确的规定时，扣除可能具有合理性。以下是对此问题的详细分析：
一、加班的法律规定
协商一致原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条，用人单位因生产经营需要加班，需与工会和劳动者协商一致，且不得违反每日及每月的加班时间限制。这表明，劳动者有权拒绝未经协商的加班要求。
特殊情况下的加班：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十二条，存在自然灾害、事故等紧急情况，或生产设备故障等必须及时抢修的情形时，用人单位可以不受加班时间限制的安排加班。但即便如此，也应尽量保障劳动者的休息权益，并依法支付加班费。
二、全勤奖的性质与扣除条件
全勤奖的定义：
- 全勤奖是公司内部制定的一种奖励制度，旨在鼓励员工按时出勤，其发放条件和标准应由公司规章制度或劳动合同明确规定。
扣除全勤奖的合法性：
- 如果公司规章制度或劳动合同中未明确规定“不加班就扣除全勤奖”，或者该规定违反了法律法规（如侵犯了劳动者的合法权益），则公司不能随意扣除员工的全勤奖。
- 即便公司规章制度中有相关规定，也需确保该规定不违反法律法规的强制性规定，且已通过民主程序制定并向劳动者公示。
三、公司强制加班并扣除全勤奖的合法性分析
一般情况下的违法性：
- 在一般情况下，公司未经与劳动者协商一致就强制要求加班，并以不加班为由扣除全勤奖，这种行为侵犯了劳动者的合法权益，构成违法。
特殊情况下的合理性：
- 在存在紧急情况或必须及时抢修等特殊情形下，公司可以安排加班且不受加班时间限制。但即便如此，如果公司规章制度或劳动合同中未明确规定在此情况下可以扣除全勤奖，或者扣除全勤奖的规定违反了法律法规的强制性规定，那么公司的行为仍然可能构成违法。
- 如果公司有合法且明确的规定，且该规定已通过民主程序制定并向劳动者公示，那么在特殊情况下扣除全勤奖可能具有一定合理性。但即便如此，公司也应尽量保障劳动者的休息权益，并依法支付加班费。
四、劳动者的权益保护与维权途径
拒绝不合理加班：
- 劳动者有权拒绝用人单位的不合理加班要求，且不应因此受到任何形式的惩罚。
与公司协商：
- 如果劳动者认为公司不合理地扣除了全勤奖，应首先与公司进行沟通协商，要求其纠正违法行为并恢复正常工作安排及足额支付工资。
向劳动监察部门投诉：
- 若协商无果，劳动者可向当地劳动监察部门投诉，由其对用人单位的违法行为进行监督检查，并责令改正及给予处罚。
申请劳动仲裁与诉讼：
- 劳动者可收集相关证据（如劳动合同、工资条、考勤记录、加班通知等），向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求支付被克扣的工资及经济补偿金。对仲裁结果不服的，还可向人民法院提起诉讼。
总结与建议：公司强制要求加班且以不加班为由扣除全勤奖的行为，其合法性需根据具体情况进行判断。在一般情况下，这种行为可能构成违法；但在特殊情况下或公司有合法且明确的规定时，扣除可能具有合理性。作为劳动者，应了解自己的合法权益，并在必要时采取适当的措施来维护自己的权益。如果你遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供更详细的法律建议。