结论：公司单方面将公积金缴存比例由12%调整为6%是否合法，需分情况讨论，核心判断依据是调整是否符合法定程序、是否低于当地最低缴存比例要求，以及是否损害员工合法权益。以下是具体分析：

1. 若调整符合法定程序且未低于当地最低比例，可能合法

根据《住房公积金管理条例》第十八条，职工和单位住房公积金的缴存比例均不得低于职工上一年度月平均工资的5%，具体比例由住房公积金管理委员会拟订，经本级人民政府审核后报省、自治区、直辖市人民政府批准。

• 合法情形：若公司调整后的6%缴存比例不低于当地政府规定的最低比例（如部分地区最低为5%），且调整程序合法（如经职工代表大会或工会讨论通过、向住房公积金管理中心备案等），则属于合法行为。
  
• 程序要求：调整比例需履行民主程序（如与职工协商、公示等），并向当地住房公积金管理中心报备。若未履行程序，即使比例合法，也可能因程序瑕疵被认定为违法。

2. 若调整低于当地最低比例或未履行程序，则违法

• 违法情形1：低于最低比例：若当地最低缴存比例为8%，公司调整为6%即违反《住房公积金管理条例》的强制性规定，员工可要求公司补缴差额，并可能面临住房公积金管理中心的行政处罚（如罚款、责令限期改正）。
  
• 违法情形2：未履行程序：即使调整后的比例合法，若公司未与员工协商、未公示或未向住房公积金管理中心备案，员工可主张调整无效，并要求公司按原比例补缴。

3. 员工维权途径

若公司调整行为违法，员工可通过以下方式维权：

• 协商：与公司沟通，要求恢复原比例或补缴差额；
  
• 投诉：向当地住房公积金管理中心举报，由其责令公司改正；
  
• 仲裁/诉讼：若公司拒不改正，员工可申请劳动仲裁或提起诉讼，要求公司承担法律责任。

4. 特殊情形：经营困难可申请缓缴或降低比例

根据《住房公积金管理条例》第二十条，单位若经营困难，可经职工代表大会或工会讨论通过，并向住房公积金管理中心申请缓缴或降低缴存比例（但需在规定范围内，如不低于5%）。若公司未履行此程序而擅自降低比例，仍属违法。

建议：若您所在公司调整公积金比例，可先查询当地最低缴存比例要求，并要求公司出示调整的合法依据（如政府批文、民主程序记录等）。若发现违法情形，可及时向住房公积金管理中心投诉或咨询我进一步处理方案。