结论：合同只有一份原件，给乙方扫描件在法律上并不完全等同于原件，其法律效力会受到一定影响。不过，在特定情况下，扫描件仍可能被视为有效证据。以下从不同角度进行详细分析：
一、扫描件与原件的法律效力差异
原件的法律效力：
- 原件是合同签订时双方真实意思表示的直接载体，具有最高的法律效力。
- 在诉讼或仲裁中，原件通常被视为最直接、最有力的证据。
扫描件的法律效力：
- 扫描件是原件的电子复制件，其法律效力通常低于原件。
- 根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》，无法与原件核对的复制件，不能单独作为认定案件事实的依据。
二、扫描件在特定情况下的有效性
双方认可：
- 如果双方当事人在合同中明确约定扫描件与原件具有同等法律效力，或者在实际履行过程中，双方均认可扫描件作为合同履行的依据，那么扫描件在特定情况下可能被视为有效。
其他证据佐证：
- 如果扫描件能够与其他证据（如电子邮件、短信、聊天记录等）相互印证，形成完整的证据链，证明合同的真实性和履行情况，那么扫描件也可能被法院或仲裁机构采纳。
特殊情形下的例外：
- 在某些特殊情形下，如原件遗失、毁损等，且无法通过其他方式获取原件时，扫描件可能作为唯一可用的证据被采纳。但这种情况需要法院或仲裁机构根据具体案情进行裁量。
三、法律建议
尽量保留原件：
- 为了避免法律纠纷和风险，建议双方当事人在签订合同时尽量保留原件，并妥善保管。
明确约定扫描件效力：
- 如果确实需要将原件交给一方保管，而另一方只能获得扫描件，建议在合同中明确约定扫描件与原件具有同等法律效力，或者约定在特定情况下扫描件可以作为有效证据使用。
加强证据保全：
- 对于重要的合同文件，建议双方当事人在签订后及时进行公证或见证，以增强扫描件的法律效力。同时，保留好与合同相关的其他证据材料，以备不时之需。
及时咨询专业律师：
- 如果在合同履行过程中遇到任何法律问题或纠纷，建议及时咨询专业律师，以便得到及时、有效的法律帮助。
总结：合同只有一份原件时，给乙方扫描件在法律上并不完全等同于原件。为了降低法律风险，建议双方当事人在签订合同时尽量保留原件，并明确约定扫描件的效力。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。