双方协商后，可以通过签订书面和解协议并履行完毕的方式了结案件。具体来说，可以从以下几个角度来详细说明：

1. 协商和解的基本流程
   双方在平等自愿的基础上，就争议事项进行充分沟通，达成一致意见后，应当将协商结果以书面形式固定下来，形成和解协议。和解协议应明确双方的权利义务、履行方式、履行期限以及违约责任等内容，以确保协议的可执行性。协议签订后，双方按照约定履行各自义务，案件即可视为了结。

2. 和解协议的法律效力
   和解协议一旦签订并履行完毕，即具有法律约束力。如果一方不履行协议，另一方可以依据协议向法院提起诉讼，要求对方承担违约责任。因此，签订和解协议时，务必确保协议内容合法、明确，避免因条款模糊或违法而导致协议无效。

3. 和解与诉讼、仲裁的关系
   协商和解是解决争议的一种灵活方式，与诉讼、仲裁等正式程序相比，具有效率高、成本低、保密性强等优点。如果双方能够通过协商达成和解，可以避免进入漫长的诉讼或仲裁程序，节省时间和精力。但需要注意的是，和解协议的履行依赖于双方的自觉，如果一方反悔，另一方仍需通过法律途径维护权益。

4. 和解后的案件了结方式
   在和解协议履行完毕后，双方可以共同向法院或仲裁机构申请确认和解协议的效力，或者由一方单方面申请撤诉（如果案件已进入诉讼程序）。法院或仲裁机构在审查确认和解协议合法有效后，会出具相应的法律文书，标志着案件正式了结。

建议：在协商和解过程中，如果涉及复杂法律问题或较大金额的争议，建议咨询专业律师，以确保和解协议的合法性和可执行性。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供详细解答。