当交通事故双方协商好后，可以按照以下步骤进行处理：

首先，双方需要达成明确的赔偿协议。这个协议应该详细列出事故的时间、地点、涉及当事人的信息、责任划分以及具体的赔偿金额和内容。协议一旦达成，双方都需要严格按照协议来履行。为了确保协议的有效性，建议双方制作一份书面的协议书，并共同签名确认。

其次，根据赔偿协议的具体内容，如果是当场赔偿，那么收款方应该出具收条作为凭证；如果不是当场赔偿，双方可以约定赔偿的方式和具体的期限。

如果在一方履行协议的过程中出现违约情况，例如未按照约定的时间或方式支付赔偿，那么另一方有权向人民法院提起民事诉讼，要求违约方承担相应的赔偿责任。在提起诉讼之前，建议收集好与事故相关的所有证据，包括事故现场照片、医疗记录、费用票据以及双方签订的赔偿协议书等，以便在法庭上作为证据使用。

另外，如果事故涉及保险理赔，那么双方还需要及时向各自的保险公司报案，并按照保险公司的要求提供相关的理赔材料。保险公司会根据事故情况和保险条款来决定是否给予理赔以及理赔的具体金额。

最后，虽然双方已经协商处理好事故，但还是建议去交警队进行备案或告知，以便交警部门对事故进行记录和统计。如果后续出现任何争议或问题，交警部门的记录也可以作为参考依据。

总的来说，交通事故双方协商好后，需要制作明确的赔偿协议并严格履行，同时保留好相关证据以备不时之需。如果涉及保险理赔或需要法律帮助，请及时咨询专业人士。