自家建房子和隔壁邻居签订的协议，在以下情况下可能无效：
协议内容违反法律、行政法规的强制性规定：
- 如果协议中的条款与国家的法律、行政法规相抵触，特别是那些强制性规定，那么这些条款将被视为无效。例如，如果协议中约定了违反建筑安全标准、土地使用规定或环保要求的内容，这样的条款是不受法律保护的。
协议双方意思表示不真实：
- 如果协议是在一方或双方受到欺诈、胁迫或乘人之危的情况下签订的，那么该协议可能被视为无效。因为这种情况下，协议并非基于双方真实、自愿的意思表示，而是受到了外部不当因素的影响。
协议内容损害社会公共利益：
- 如果协议的内容损害了社会公共利益，比如涉及非法占用公共资源、破坏环境等，那么这样的协议也是无效的。因为法律保护的是社会公共利益，任何损害公共利益的行为都将受到法律的制裁。
协议主体不适格：
- 如果签订协议的一方或双方不具备相应的民事行为能力，比如未成年人或精神病人未经法定代理人同意签订的协议，那么这样的协议可能是无效的。因为民事行为能力是签订合同的基本前提，不具备相应能力的人签订的合同可能无法产生法律效力。
协议形式不合法：
- 虽然大多数情况下，口头协议也是有效的，但对于一些特定的法律行为，如房屋买卖、赠与等，法律要求必须采用书面形式。如果自家建房子和邻居签订的协议涉及这些特定法律行为，但未采用书面形式，那么该协议可能因形式不合法而无效。不过，这一点主要取决于协议的具体内容和当地法律的具体规定。
在签订协议时，为了确保协议的有效性，建议注意以下几点：
- 明确协议内容：确保协议中的条款清晰、明确，没有歧义或模糊之处。
- 遵守法律法规：确保协议的内容不违反国家的法律、行政法规的强制性规定。
- 保护自身权益：在签订协议前，仔细阅读协议条款，确保自己的权益得到充分保护。
- 寻求法律意见：如果对协议的内容或法律效力有疑问，可以寻求专业律师的法律意见。
如果已经签订了可能无效的协议，建议采取以下措施：
- 与对方协商：尝试与对方协商，看是否能够修改协议内容或达成新的协议。
- 寻求法律救济：如果协商无果，可以寻求法律救济，如向法院提起诉讼或申请仲裁等。
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