当遇到程序不合法的规范性文件时，这是一个涉及法律审查与处理程序的问题，我会为您详细解答。
首先，需要明确的是，人民法院在审理行政案件时，对于经审查认为不合法的规范性文件，并不会直接作出认定。这一做法是出于保障行政权力的合理运行以及维护规范性文件体系的稳定性和严肃性的考虑。
接下来，我们详细了解一下法院对不合法规范性文件的处理程序：
法院审查的权力与依据：
- 法院有权根据《中华人民共和国行政诉讼法》的规定，对涉及的规范性文件进行合法性审查。
- 审查内容广泛，包括规范性文件是否符合法律、法规、规章和上级规范性文件的规定，是否遵循公平竞争原则，是否体现职权与责任相统一的原则，以及制定过程是否公开透明等。
处理程序：
- 法院在裁判文书中会明确阐述不将该规范性文件作为认定行政行为合法依据的理由，这是法院对规范性文件合法性审查结果的一种体现。
- 同时，法院会向制定机关提出处理建议，并可抄送制定机关的同级人民政府或上一级行政机关。这一步骤旨在促使相关行政机关认识到问题并纠正违法行为。
法律效力及影响：
- 虽然法院不直接认定规范性文件不合法，但其通过裁判理由的阐明和处理建议的提出，实际上对该规范性文件在相应范围内的法律效力产生了影响。
- 法院可以依据对规范性文件合法性的审查结果，对依据该规范性文件作出的行政行为作出相应的处理，如撤销、变更或确认违法等。
- 这一处理程序对行政机关具有规范作用，有助于促使其更加谨慎地制定和执行规范性文件，从而维护法律的权威性和公正性。
综合建议：
- 如果您认为某个规范性文件程序不合法，并且该文件与您的行政案件相关，您可以在诉讼过程中向法院提出对该文件的合法性审查请求。
- 法院将依法进行审查，并在裁判文书中阐明其审查结果和处理建议。
- 同时，您也可以关注法院向制定机关提出的处理建议，以及制定机关后续的纠正行为。
总之，虽然法院不直接认定规范性文件不合法，但通过其审查程序和处理建议，实际上对不合法的规范性文件产生了间接的法律效力，并对行政机关的后续行为产生了规范作用。希望这一解答能够帮助您更好地理解法院对不合法规范性文件的处理程序。