结论：生病了上班不方便而辞职，是否合法获得工资需根据具体情况分析。若已履行通知义务并提供病假证明，用人单位不得随意克扣工资；若未履行通知义务或未提供充分证据，且给用人单位造成了经济损失，用人单位在符合法律规定的情况下，有权要求赔偿部分经济损失，但不得随意克扣全额工资。
详细分析：
已履行通知义务并提供病假证明的情况：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 若劳动者因生病需要辞职，并已按照公司规定或双方约定提前通知了用人单位，同时提供了合理的病假证明（如医院的诊断证明、病历等），证实自己因病需要离职休息，那么用人单位扣工资就属于违法行为。在此情况下，劳动者有权要求用人单位按时支付全额工资。
未履行通知义务或未提供充分证据的情况：
- 若劳动者生病辞职，但未提前通知用人单位或未提供充分的医疗证据证明是因生病而辞职，且这种突然离职的行为给用人单位造成了直接经济损失，用人单位在法律允许的范围内可以要求劳动者赔偿经济损失。不过，用人单位需对损失承担举证责任，并且扣除的工资不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。
法律建议与应对措施：
劳动者：
- 为避免此类纠纷，建议劳动者在因生病需要辞职时，务必保留好相关的医疗证明，并尽量按照公司规定或双方约定提前通知用人单位。
- 若遇到生病辞职被不合理扣工资的情况，劳动者应首先与用人单位协商解决；协商不成的，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
用人单位：
- 用人单位应遵守法律规定，合理处理员工的辞职事宜，不得随意克扣工资。
- 若员工突然离职给用人单位造成了经济损失，用人单位应依法要求赔偿，并确保扣除的工资不超过法定限额。
示例说明：
假设劳动者小李因生病需要辞职，他提前一周通知了用人单位，并提供了医院的诊断证明。在此情况下，用人单位不得随意克扣小李的工资。若用人单位无故克扣，小李有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
再假设劳动者小张因生病未提前通知用人单位就辞职了，且未提供医疗证明。用人单位因此遭受了经济损失，如因小张突然离职导致项目延期产生的额外费用。在此情况下，用人单位可以要求小张赔偿部分经济损失，但扣除的工资不得超过小张当月工资的20%。
综上所述，生病了上班不方便而辞职是否合法获得工资，需根据具体情况判断。劳动者应了解相关法律法规，确保自身权益不受侵害；同时，用人单位也应遵守法律规定，合理处理员工的辞职事宜。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。