对公账户流水虚假属于严重的违法行为，需根据不同情形承担相应法律责任，具体处理方式如下：

1. 民事责任层面
   若虚假流水用于签订、履行合同，可能构成《民法典》第148条规定的欺诈行为。受损害方有权请求法院或仲裁机构撤销合同，并要求行为人赔偿实际损失（如资金占用利息、交易机会损失等）。例如企业通过伪造流水获取贷款后违约，银行可主张赔偿全部融资成本。

2. 行政责任层面
   根据《商业银行法》第73条，银行工作人员参与伪造流水的，监管部门可处5-50万元罚款；对单位最高处200万元罚款。企业若通过违规手段获取行政许可（如招投标资质审核），主管机关可撤销许可并处10万元以下罚款。

3. 刑事责任层面

• 骗取贷款罪（《刑法》第175条之一）：虚假流水使银行误判还款能力发放贷款，数额超100万元或造成20万元以上损失的，处3-7年有期徒刑
  
• 贷款诈骗罪（《刑法》第193条）：以非法占有为目的伪造流水，数额超2万元即达立案标准，最高可处无期徒刑
  
• 妨害信用卡管理罪：若通过虚假流水办理大额信用卡后恶意透支，数额超5万元经2次有效催收仍不还款的，构成该罪
  
• 帮助信息网络犯罪活动罪：为网络诈骗团伙提供虚假流水走账，情节严重的处3年以下有期徒刑
  

实务建议：

1. 立即停止使用虚假流水，对已提交的材料主动向相关部门说明情况
   
2. 保留原始交易凭证、沟通记录等证据，证明实际经营状况与流水差异的合理性
   
3. 若涉及刑事风险，建议在律师陪同下向公安机关说明情况，争取自首情节认定
   
4. 对已造成的损失，可通过民事诉讼主张过错方承担赔偿责任
   

特别提醒：根据最高检《关于办理涉互联网金融犯罪案件有关问题座谈会纪要》，银行流水作为关键书证，司法机关可通过调取资金流向、IP地址、MAC地址等技术手段固定证据。建议企业建立合规审查机制，定期委托会计师事务所进行流水核验。