核心结论：若承兑未开通但对方已付款，款项通常不会因未开通承兑而自动退回，具体处理方式需结合付款方式、合同约定及双方协商情况综合判断。以下是具体分析：

1. 先确认付款方式及款项状态

• 银行转账/电汇：若对方通过银行转账（如企业网银、电汇）付款，款项会直接进入您公司账户（或个人账户），与是否开通承兑无关。此时需核对银行流水，确认款项是否到账。
• 票据付款（如汇票、本票）：若对方以票据形式付款（如银行承兑汇票、商业承兑汇票），但您未开通承兑业务，票据可能无法兑付。此时需联系对方或其开户行，确认票据是否已退回或需其他操作（如背书转让、贴现）。

2. 检查合同或协议约定

• 若双方签订的合同中明确约定了付款方式（如“必须通过银行承兑汇票支付”），而您未开通承兑导致对方无法完成付款义务，可能构成违约。此时需与对方协商补救措施（如更换付款方式、延长付款期限）。
• 若合同未明确约定付款方式，或允许其他付款方式（如电汇），则对方已实际付款的行为通常视为履行合同，您无需因未开通承兑而承担责任。

3. 与对方沟通协商

• 款项已到账：若款项已进入您账户，无需特殊处理，但建议书面确认收款事实，避免后续纠纷。
• 票据无法兑付：若因未开通承兑导致票据无法兑付，需与对方协商解决方案（如退回票据、更换付款方式）。若对方坚持要求承兑，您可能需承担违约责任（如赔偿对方因票据无法兑付产生的损失）。

4. 法律风险提示

• 票据法规定：根据《票据法》，承兑是汇票付款人承诺在汇票到期日支付汇票金额的票据行为。若您未开通承兑业务，可能无法成为合法承兑人，票据可能被退回或视为未承兑。
• 合同履行风险：若因未开通承兑导致对方无法按约定付款，可能影响合同履行进度，甚至引发诉讼。建议提前评估风险，必要时在合同中约定替代付款方式。

5. 建议操作步骤

1. 立即核对银行账户或票据状态，确认款项是否到账或票据是否被退回。
2. 查阅合同条款，明确付款方式及违约责任。
3. 与对方书面沟通（如邮件、函件），说明情况并协商解决方案。
4. 若涉及票据问题，咨询开户行或票据专家，确认后续操作流程。
5. 保留所有沟通记录及付款凭证，以备后续争议使用。

总结：承兑未开通通常不影响已实际到账的款项，但可能影响票据兑付。建议优先与对方协商，明确付款方式及合同履行细节，必要时咨询专业律师或财务人员协助处理。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律问题。