医师违法行为的行政处罚时效一般为二年，但在涉及公民生命健康安全且有危害后果的特殊情况下，可延长至五年。以下是对这一问题的详细分析：

一、一般规定

根据《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定，医师违法行为的行政处罚时效通常为二年。这意味着，如果医师的违法行为在二年内未被行政机关发现，那么之后通常就不能再对该违法行为进行行政处罚。这一时效的计算是从违法行为发生之日起开始的；如果违法行为是连续或者继续状态的，那么时效就从行为终了之日起计算。

二、特殊情况

然而，也存在一些特殊情况。特别是当医师的违法行为涉及公民生命健康安全，并且造成了危害后果时，行政处罚的时效会延长至五年。这是为了更好地保护公民的生命健康权益，确保对严重违法行为的追责不受时间限制。同样地，这一延长的时效也是从违法行为发生之日（或行为终了之日，如适用）起计算的。

三、法律后果与建议

1. 法律后果：

   • 如果医师的违法行为在行政处罚时效内被发现，行政机关将依法对其进行处罚，包括警告、罚款、吊销执业证书等。
   • 如果违法行为超过了行政处罚时效，行政机关通常将不再对其进行处罚，但医师仍可能面临民事赔偿等法律责任。

2. 建议：

   • 医师应严格遵守相关法律法规和医疗规范，确保自己的医疗行为合法合规，避免违法行为的发生。
   • 如果医师发现自己的医疗行为可能存在问题或违法行为，应及时向行政机关报告并主动纠正，以减轻或避免法律责任。
   • 对于患者或家属来说，如果发现医师存在违法行为，应及时向行政机关举报，以便行政机关及时查处并保护患者的合法权益。

四、实际应用中的注意事项

• 在实际应用中，行政处罚时效的计算可能因具体情况而有所不同。例如，如果违法行为是连续或继续状态的，时效的计算将从行为终了之日起开始。
• 此外，如果医师的违法行为涉及多个法律条款或多个行政机关的管辖范围，可能需要综合考虑多个因素来确定行政处罚时效。

综上所述，医师违法行为的行政处罚时效根据具体情况有所不同。在实际应用中，应仔细审查相关法律法规和具体事实，以确保对医师违法行为的追责合法合规。如果你有任何关于医疗医患（事故责任及赔偿）的法律问题，可以直接向我咨询。