关于您提出的“单位发放的停工留薪工资是否应当抵扣保险公司的误工赔偿”这一问题，我可以明确地告诉您：误工费和停工留薪期工资在法律上不能相互抵消。接下来，我将从几个方面为您详细解释这一结论。
首先，我们需要明确误工费和停工留薪期工资的概念及其法律依据：
误工费：
- 概念：误工费是指受害人因遭受人身损害（如交通事故、故意伤害等）而无法从事正常工作，进而导致的收入损失。这部分损失，赔偿义务人（通常是侵权人或其保险公司）需要向赔偿权利人（即受害人）进行支付。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一千一百七十九条的规定，侵害他人造成人身损害的，应当赔偿因误工减少的收入。
停工留薪期工资：
- 概念：停工留薪期工资是职工因工作原因受伤或患职业病，需要暂停工作接受治疗期间，用人单位按月支付给职工的原工资福利待遇。
- 法律依据：依据《工伤保险条例》第三十三条的规定，职工因工伤或患职业病需暂停工作的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变。
接下来，我们分析两者的法律性质与支付主体：
- 误工费属于民事赔偿责任范畴，通常由侵权人或其保险公司承担支付责任。其目的在于补偿受害人因侵权行为导致的实际收入损失。
- 停工留薪期工资则是基于劳动关系和工伤保险制度产生的法定待遇，由用人单位支付。其目的在于保障工伤职工在治疗期间的基本生活需求和经济利益。
再来看两者的适用情形与功能：
- 误工费主要适用于侵权赔偿场景，如交通事故、故意伤害等，当劳动者因第三人侵权导致人身损害时，可向侵权人主张误工费赔偿。
- 停工留薪期工资则专门适用于工伤赔偿场景，当劳动者因工作原因受伤或患职业病时，可享受工伤保险待遇，包括停工留薪期工资。
最后，从司法实践的角度来看：
在司法实践中，多数法院都认为误工费和停工留薪期工资是基于不同的法律关系产生的赔偿项目，它们之间不能相互抵消。即使劳动者因第三人侵权造成工伤，并同时获得了误工费和停工留薪期工资，这也不构成重复获利或不当得利。因为这两部分费用分别基于不同的法律制度和法律关系，是劳动者在不同情境下应享有的合法权益。
综上所述，误工费和停工留薪期工资在法律性质、支付主体、适用情形以及功能和目的等方面均存在显著差异，因此它们之间不能相互抵消。劳动者在遭受人身损害或工伤时，应根据相关法律法规的规定，分别主张自己的合法权益。希望这一解答能够对您有所帮助。