结论：停工留薪期工资一般不能做误工费扣除，二者在法律性质、支付主体和目的上存在明显区别，在大多数情况下可以同时获得。不过，也存在一些特殊情况可能影响最终的处理方式，以下为你详细分析：
不可抵减的情况及理由
- 法律性质差异
- 误工费：属于民事侵权赔偿项目，依据《中华人民共和国民法典》第一千一百七十九条规定，侵害他人造成人身损害的，应当赔偿因误工减少的收入。它由侵权的第三人（如肇事司机或其保险公司）承担赔偿责任，旨在弥补受害人因受伤无法正常工作而减少的收入。
- 停工留薪期工资：属于工伤保险待遇，根据《工伤保险条例》第三十三条第一款规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。其目的是保障职工因工作遭受事故伤害或患职业病期间的原工资福利待遇不变。
- 赔偿主体不同
- 误工费由侵权的第三人支付，比如交通事故中，责任方司机或其投保的保险公司需要向受伤者赔偿误工费。
- 停工留薪期工资由用人单位按月支付，即使单位缴纳了工伤保险，也需承担此义务。例如，某企业员工在工作时受伤，在停工留薪期内，企业要按照规定向该员工支付原工资福利待遇。
- 填平原则适用限制
- 民事侵权赔偿遵循填平原则，但工伤保险具有社会保障属性，两者并非同一法律关系。因此，劳动者在获得误工费赔偿后，仍可全额享受停工留薪期工资，以充分保障其合法权益。比如，员工因交通事故受伤，既获得了肇事方的误工费赔偿，同时也能从用人单位处获得停工留薪期工资。
- 工伤与非工伤的区分
- 因工作受伤时，停工留薪期工资是工伤保险制度的直接体现，与误工费无直接关联，不应抵减。例如，建筑工人在工地施工时受伤，进入停工留薪期，其应获得停工留薪期工资，同时如果是因为第三方原因导致受伤，还可向第三方主张误工费。
可以抵减的情况及考虑因素
尽管在大多数情况下误工费与停工留薪期工资不应抵减，但在某些特殊情况下，从公平角度出发，可能会考虑避免劳动者双重获利：
- 双重补偿的考量：如果允许劳动者在获得误工费的同时又全额领取停工留薪期工资，可能导致其因受伤而获得超出实际损失的利益。例如，劳动者受伤后实际误工损失为5000元，但其既获得了第三方赔偿的8000元误工费，又从用人单位处领取了6000元停工留薪期工资，这样就超出了实际损失。不过，这种做法在司法实践中并不普遍，具体是否抵减需依据受伤原因、赔偿主体以及当地司法实践等因素综合判断。
实际操作建议
- 了解当地规定：由于不同地区司法实践存在差异，在处理此类问题时，应首先了解当地的具体规定和司法裁判倾向。比如，某些地区可能对于特定类型的工伤事故中误工费和停工留薪期工资的处理有更详细的地方性法规或司法解释。
- 收集证据材料：无论是主张误工费还是停工留薪期工资，都需要收集相关的证据材料。对于误工费，要提供医疗机构出具的误工时间证明、收入证明等；对于停工留薪期工资，要提供工伤认定决定书、停工留薪期确认通知等材料。
如果你在处理此类问题时遇到困难或有其他疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。